基于网络药理学的补阳还五汤防治阿尔茨海默病的机制研究(2)
1.2 方法1.2.1 构建补阳还五汤化学成分数据库 通过TCMID数据库和美国国家医学图书馆PubMed数据库检索补阳还五汤中所含化学成分[7-13],特别是口服补阳还五汤后入血成分[14],构建补阳还五汤所含化学成分数据库。
1.2.2 靶点预测及筛选 基于补阳还五汤的化学成分,BATMAN-TCM数据平台对补阳还五汤所含化学成分进行化合物-作用靶标预测,并设定阈值收录分子对接打分最高的前10个靶点用于下一步靶点及药物作用网络分析;将补阳还五汤中所含的143个化学成分全部带入ChemBioOffice 2014软件,用于生成具有化学物3D结构的mol2文件,并将其分别带入PharmMapper反向药效团匹配数据库,根据空间结构预测与其对接不同程度的作用靶点;同时将上述143个化合物带入STRING 10.5功能蛋白的关联网络数据库预测药物靶点。最后将上述结果进行汇总全部输入蛋白质生物功能数据库(UniProt),将其校正为官方名称。
1.2.3 通路获取及生物机制分析 将获取的所有靶点编号带入MAS 3.0数据库 ......
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