1 资料与方法

    1.1 一般资料

    资料来源GEO在线数据库(http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)，下载食管鳞癌全基因组表达谱芯片数据集。入选条件：①全基因组RNA表达谱芯片;②人食管鳞癌组织与配对的癌旁正常组织。

    1.2 方法

    1.2.1 分析差异表达基因 ①数据预处理：将下载的芯片数据导入R语言，经RMA法进行背景校正和矩阵数据归一化处理获得标准化芯片表达矩阵数据;②筛选差异表达基因：使用“Limma”包[3]筛选差异倍数(FC)>2且P < 0.01的数据作为有意义的差异表达基因，并使用“ggplot”包绘制火山图。

    1.2.2 共同差异表达基因 将筛选出的各个基因芯片数据集的差异表达基因取交集，获得共同的差异表达基因。

    1.2.3 GO与KEGG通路富集分析 将共同差异表达基因导入DAVID 6.8分析工具(http：//david-d.ncifcrf.gov)[4]，进行GO与KEGG通路富集分析[5]，条件设定为P < 0.01，结果使用“ggplot 2”包[6]绘制气泡图 ......