基于网络药理学分析枸杞子的作用机制(2)
1.3 靶点蛋白的基因功能(GO)和通路富集(KEGG)分析将靶点蛋白输入DAVID 6.8数据库进行GO和KEGG,以“P < 0.05,基因数>10”作为条件进行筛选,按Count数由大到小顺序,选取排名前20位作图。
2 结果
2.1 枸杞子活性成分及靶点蛋白
在BATMAN-TCM平台以枸杞子为关键词进行搜索,共得到188个活性成分,综合样本数量、数据的复杂性及文献角度,以OB≥30%、DL≥0.18筛选活性成分,筛选出45种活性成分,包含多糖、甾醇类,生物碱等,45种活性成分的详细信息见表1。枸杞子36个活性成分(45个活性成分中的9个活性成分没有相对应靶点)作用靶点去除重复共计208个,活性成分与对应靶点详细信息见表2。
2.2 枸杞子活性成分靶点蛋白互作网络
在STRING平台构建的枸杞子活性成分PPI网络图中共有节点189个、3081边条,平均度值为32.6,平均介数为0.593。见图1。
2.3 靶点蛋白的基因功能和通路富集分析
对枸杞子208个蛋白靶基因进行GO富集分析 ......
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