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编号:12792985
口腔鳞状细胞癌和癌旁组织的基因表达分析(1)
http://www.100md.com 2015年6月1日 国际口腔医学杂志 2015年第3期
口腔鳞状细胞癌和癌旁组织的基因表达分析,双边药物靶标,功能聚类
     [摘要]目的 利用来自美国国立生物信息技术中心(NCBI)基因表达数据库(GEO)的基因芯片数据,分析基因在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中癌和癌旁组织的差异表达情况,为寻找癌和癌旁组织双边的抑癌靶标提供依据。方法 选取来自NCBI-GEO数据库中OSCC患者的癌和癌旁组织,以及正常人口腔组织的基因芯片数据,分别计算得到前两者相对后者的差异表达基因,并进行功能聚类与特定基因的通路分析。结果 大部分差异基因为癌与癌旁所共有,其中多数基因的差异表达方向在两者中一致,少部分方向不一致。如WIFl基因在癌组织中表达下调,但在癌旁组织中表达上调。这种差异表达行为的不同与基因的功能相关,因此,差异表达行为可能为抑癌靶标的发现提供线索。结论 基因在癌和癌旁组织中的差异表达行为与基因的功能相关,具有特定差异表达行为的基因可能成为潜在的抑癌靶标。

    [关键词]口腔鳞状细胞癌;双边药物靶标;功能聚类

    [中图分类号]R782 [文献标志码]A [doi]10.7518/gjkg.2015.03.016

    肿瘤的发生与发展不仅依赖肿瘤本身,还需要与肿瘤周边组织的相互作用。近年来的研究提出了双边扰动治疗方案的概念,同时对肿瘤与其周边组织中的靶标进行扰动,以达到抑制癌细胞生长的目的。该方案的一大挑战,便是如何发现有效的抑癌靶标组合。本文以口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma ......
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