网络药理的大黄素及其类似物抗肿瘤分子机制研究
靶点,1资料与方法,1大黄素类似物筛选,2基因靶点预测,3蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)分析,4KEGG通路分析,2结果,1大黄素类似物筛选结果,2大黄素及7个类似物潜在的基因靶点,3基因靶点相互作用网络分析,4
秦春明大黄素是大黄、何首乌等常见中药材中的一个活性成分,具有良好的抗肿瘤、抗炎和抗微生物等方面作用[1]。因为大黄素具有多种生物活性,同时在合成的大黄素类似物中也表现出不同的生物活性,特别是在抗肿瘤活性方面有着巨大地开发潜力[2]。然而,大黄素及其类似物的药理及分子机制的研究需深入开展,大黄素及其类似物的药物靶点特别是基因靶点的作用环节十分复杂,常规药理和分子机制研究方法很难全面揭示抗肿瘤药理和分子机制[3]。本研究同时借助多个在线数据库资源,分析大黄素及 其类似药物中已知基因靶点的生物学信息,借助相互作用网络,通过关键基因通路分析,建立“药物-靶点-通路”网络,为进一步了解大黄素及其类似物抗肿瘤活性、分子机制提供资料和思路。
1 资料与方法
1.1 大黄素类似物筛选
药物数据DrugBank(https://www.drugbank.ca/)是世界最大、最完整的药物资源库,由加拿大卫生研究院提供支持。通过检索全医药学大词典,获取 大黄素化学名称列表,将该列表导入DrugBank 数据库中在线检索,基于化合物结构相似、生物活性相近的原则,以相似度评分为标准筛选药物,以系统默认的相似度评分阈值>0.7 为标准[4],获取高相似度药物的编号及药物名称。
1.2 基因靶点预测
生物医学文本挖掘的一个关键任务是发现各种生物医学实体之间的潜在关联,Polysearch 2.0(http: //polysearch.cs.ualberta.ca/)是一个在线文本挖掘系统,可以用于识别人类疾病、基因、蛋白质、药物等之间关系的生物数据库。将大黄素及其类似物列表,通过Polysearch 2.0 数据库检索,获取大黄素及其类似物已知靶点列表 ......
您现在查看是摘要页,全文长 6917 字符。