余科权 吴 敏

    人程序性死亡配体1(programmed death-ligand 1,PD-L1)是程序性死亡分子受体1的配体，由CD274基因编码[1]。PD-L1具有抑制T细胞效应功能，可能在预防宿主细胞自身免疫和免疫介导的杀伤中发挥作用，近年来兴起的针对PD-L1的单克隆抗体的免疫治疗在晚期肿瘤方面取得了巨大的进展[2]。对于开发抗PD-L1抗体以干扰这个途径的小分子药物是非常值得期待并且具有应用前景的，但其发展受结构信息不足的阻碍[3]。本研究运用生物信息学的方法预测并分析PD-L1蛋白的结构，为其进一步的功能研究及相关药物研发提供一定的参考。

    1 材料与方法

    1.1 材料

    从UniProt(http://www.uniprot.org/)网站上获取人的PD-L1蛋白的氨基酸序列(Q9NZQ7-1)。

    1.2 方法

    利用ProtParam在线工具http://web.expasy.org/protparam/预测人PD-L1蛋白的相关理化性质。利用ProtScale(http://web.expasy.org/protscale/)在线预测网站对人PD-L1蛋白的亲水性及疏水性进行预测及评估。利用TMHMM(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)在线预测网站对人PD-L1蛋白跨膜区域进行预测及评估。利用SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/)在线预测网站对人PD-L1蛋白二级结构进行预测及评估。利用Swiss-Model(https://swissmodel.expasy.org/)在线预测网站对人PD-L1蛋白三级结构进行预测及评估。利用STRING(http://string-db.org/)在线预测与人PD-L1蛋白相互作用的相关蛋白。利用(https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/)在线获取PD-L1蛋白的树文件，分析预测PD-L1蛋白的同源性。利用信号肽预测服务器(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)分析预测PD-L1蛋白是否有信号肽 ......