基于网络药理学探讨桃仁-红花药对治疗膝骨性关节炎的作用机制
靶点,1方法,1筛选“桃仁-红花”有效成分和靶点,2筛选KOA相关靶点基因,3药物,疾病共同靶点的筛选及韦恩图的构建,4蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的构建,5药物-有效成分-疾病-靶点网络的构
赖财荣 雷 升 窦志芳* 任锡禄膝骨性关节炎(knee osteoarthritis, KOA)是一种退行性疾病,主要表现为多种致病因素作用下软骨细胞及细胞基质合成与分解的动态平衡被打破,从而导致膝关节软骨的破坏增生,继而导致关节间隙变窄,临床主要表现为关节疼痛、关节腔积液,甚至活动障碍;在最新的风湿协会关节炎管理指南中提到,KOA的治疗以缓解症状、减轻病情为主要手段,主要采用非甾体抗炎药及解热镇痛药等缓解患者的症状、透明质酸及氨基葡萄糖等药物来减缓病情的发展[1];在疾病的后期甚至通过手术治疗KOA;长期服用西药不仅引起一系列身体损伤,而且价格昂贵;中医药治疗KOA有独特的优势,不仅廉价、不良反应少,疗效也可以保证[2-4]。
桃仁-红花药对出自《医宗金鉴》桃红四物汤。桃仁苦以泄滞血,红花辛散温通,活血通经,散瘀止痛,两药相须为用,一升一降,一散一收,活血祛瘀之力倍增,且有活血生新,消肿止痛之功。KOA属于中医“痹症”“痹病”的范畴。桃仁、红花药对已广泛应用于KOA治疗中,身痛逐瘀汤等治疗KOA的经典方剂中就包含桃仁、红花这一药对;但对这一药对治疗KOA的作用机制尚无系统阐述。网络药理学作为一个新兴学科,基于分子层面,通过数据的可视化分析,构建药物-有效成分-疾病-靶点网络来预测药物治疗疾病的作用机制。本研究基于网络药理学探讨桃仁-红花药对治疗KOA的作用机制,为中医药治疗KOA提供理论依据。
1 方法
1.1 筛选“桃仁-红花”有效成分和靶点
中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP, http://tcmspw.com/tcmspsearch.php),以“桃仁、红花”为药物名称,分别检索出相应药物的有效成分,并根据口服生物利用度(oral bioavailability, OB)以及类药性(drug likeindex, DL)对其进行筛选,OB是指药物被吸收进入人体循环的速度与程度;DL指的是化合物与已知药物的相似性。相关研究表明,OB>30%具有较好的口服生物利用度,DL>0.18具有较好的类药性[5]。本研究通过上述两个指标对药物有效成分进行筛选,得到符合标准的有效成分,并通过TCMSP数据库预测筛选后成分的作用靶点,再把预测的靶点基因导入到Uniprot数据库(http://www.uniprot.org/)进行基因标准化。
1.2 筛选KOA相关靶点基因
在药物作用靶点数据库(TTD,http://db.idrblab.net/ttd/) ......
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