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编号:598244
基于网络药理学探究桂冰腰痛栓治疗腰椎间盘突出症的作用机制
http://www.100md.com 2022年7月30日 中国药物经济学 2022年第7期
靶点,1材料与方法,1有效成分的获取和靶点的筛选,2腰椎间盘突出症的靶点筛选,3蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络的的构建,4基因本体(geneo
     代 倩 蒋桓宇 冯银豪 杜霁航 金 龙 罗 建

    腰椎间盘突出症是以腰椎间盘纤维环破裂,髓核压迫神经根,神经根出现水肿等病理改变为特征的一种常见临床疾病,以腰痛、下肢坐骨神经放射痛、行动受限等为主要症状[1]。治疗方法除手术外,非甾体类抗炎药,中药口服以及推拿手法、针灸都是临床常用且有效的方法。

    桂冰腰痛栓是医院研发的院内制剂,由川乌、肉桂、姜黄、白芍、麝香、冰片组成,前期的临床研究表明桂冰腰痛栓配合推拿手法可以取得确切的临床效果[2]。但对于其具体的分子生物机制尚不明确,基于此,本研究使用网络药理学的研究方法对桂冰腰痛栓干预腰椎间盘突出症的分子生物学机制进行预测,以获得潜在的靶点、通路等信息,对未来的临床、动物研究提供一定的理论基础。

    1 材料与方法

    1.1 有效成分的获取和靶点的筛选

    通过挖掘中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)[3]寻找桂冰腰痛栓各中药的有效成分,满足口服利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.10的成分视为活性成分。由于TCMSP 未纳入人工麝香的有效成分,因此本研究通过查询文献的方法寻找该味药物的有效成分纳入研究。以得到的有效成分名称为关键词在PubChem数据库[4]下载其2D结构文件(sdf),将结构文件导入SwissTargetPrediction 数据库[5]进行靶点预测,得到桂冰腰痛栓的所有靶点。

    1.2 腰椎间盘突出症的靶点筛选

    以“Lumbar Disc Herniation”为关键词,通过GeneCards、TTD、Drugbank、OMIM[6-9]4 个数据库寻找和LDH 有关靶点,将得到的结果进行合并,去除重复值后得到腰椎间盘突出症有关的疾病靶点。

    1.3 蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络的的构建

    使用TBtools[10]进行韦恩图的绘制,将桂冰腰痛栓有关靶点作为List1,腰椎间盘突出症有关靶点作为List2 ......

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