网络药理学联合GEO芯片及分子对接探讨通窍活血汤治疗阿尔茨海默病的机制
差异基因,靶点,1材料与方法,1TQHXD药物成分及靶点获取,2AD差异基因获取,3TQHXD药物成分-靶点-差异基因-疾病网络的构建,4TQHXD治疗AD的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI
王 伟 宫秀群阿尔茨海默病(alzheimer's disease,AD)是一种隐匿起病、进行性发展的神经退行性疾病。AD的主要临床特征为认知障碍、精神行为异常和社会生活功能减退。据WHO统计,目前全球约有5 000万人患有痴呆,其中AD是最常见的类型。《中国阿尔茨海默病报告2022》[1]指出,我国60岁以上痴呆患者有1 507万,其中AD患者有983万。AD患者的生活能力下降,需要长期的护理和医疗服务,给家庭和社会带来沉重的经济和护理负担。一项全国性研究显示,2015年中国AD患者的年治疗费用为1 677.4亿美元,且持续上升,预计到2050中国AD患者的年治疗费用将达1.8万亿美元。
AD的发病机制复杂,涉及多个病理生理过程,如β淀粉样蛋白沉积、tau蛋白磷酸化、神经炎症、神经元损伤和凋亡、突触可塑性受损、乙酰胆碱等神经递质不足等[2]。现有的治疗药物如胆碱酯酶抑制剂、谷氨酸受体拮抗剂等只能改善和缓解临床症状,但不能逆转病情的发展且存在副作用[2]。长期的临床实践表明,中药复方因副作用小,且具有多成分多作用靶点的特点,成为近年来AD药物研究的热点[3]。
通窍活血汤(Tongqiao Huoxue decoction,TQHXD)是清代名医王清任创立的中医经典方剂,由桃仁、红花、川芎、赤芍、大枣、葱、生姜和麝香8味中药构成,具有通窍醒神、活血化瘀之功效。多项临床研究表明,TQHXD能够改善痴呆患者的认知功能,提高日常生活能力[4-5]。但TQHXD治疗AD的机制仍不明确,本文以TQHXD中活性成分为研究对象,应用网络药理学结合GEO芯片及分子对接方法,挖掘TQHXD的主要活性成分和靶点,建立中药活性成分-靶点-疾病之间的关系,探究TQHXD治疗AD的分子基础和作用机制,为TQHXD的进一步开发利用提供参考。
1 材料与方法
1.1 TQHXD药物成分及靶点获取
通过检索中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP,https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)获得TQHXD中桃仁、红花、川芎、赤芍、大枣、葱、生姜7味中药的所有化合物成分,TCMSP数据库未收录麝香,故通过检索TCMID(http://47.100.169.139/ tcmid)数据库获得麝香的药物成分。根据吸收、分布、代谢、排泄(absorption,distribution,metabolism,and excretion,ADME)规则,以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30% ......
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