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编号:598076
基于网络药理学与分子对接分析都梁丸抗偏头痛的作用机制
http://www.100md.com 2023年10月10日 中国药物经济学 2023年第8期
靶标,靶点,1材料与方法,1主要数据库和软件,2化合物信息,3化合物潜在靶点的反向预测,4潜在靶点的筛选,5蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的构建,6基因本体(GO)富集分析和KEGG通路注释分析,7活
     王 静 朱春璐 袁子民*

    都梁丸收载于2020 版《中华人民共和国药典》一部[1],由白芷(酒炖)和川芎组成,具有祛风散寒、活血通络功效,临床用于风寒瘀血阻滞脉络所致的头痛,但其作用机制尚未完全阐明。本研究结合前期研究确定的都梁丸入血成分,利用网络药理学与分子对接技术,通过基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释分析等生物学信息手段对靶点及通路进行分析,深入研究都梁丸的效应物质、质量标志物(Q-Marker),探讨都梁丸抗偏头痛的作用机制,为都梁丸的临床应用、药效物质基础与作用机制的深入研究提供科学依据。

    1 材料与方法

    1.1 主要数据库和软件

    主要数据库和软件见表1。

    表1 主要数据库和软件

    1.2 化合物信息

    本研究前期血清药物化学研究结果表明,都梁丸中有12 种活性成分入血,可能为其主要的药效物质基础,即花椒毒酚、水合氧化前胡素、白当归素、氧化前胡素、白当归脑、佛手柑内酯、欧前胡素、异欧前胡素、阿魏酸、洋川芎内酯Ⅰ、洋川芎内酯A、藁本内酯,其中白芷有8 个,川芎有4 个[2]。通过TCMSP 数据库检索12 个化合物的结构、成分编号(MOL.ID)、分子式信息。见表2。

    表2 都梁丸入血的化学成分

    1.3 化合物潜在靶点的反向预测

    采用ChemBioDraw Ultra 14.0 中Structure 选项下的“Covert Name to Structure”的功能绘制出12 个化合物的2D 结构,并以MDL SDfile(*.sdf)格式保存。再打开Chem3D 软件,将12 个化合物的2D结构转换为3D 结构,并以SYBYL2(*.mol2)格式保存后,上传到PharmMapper Serve 服务器进行靶标反向预测,以活性小分子为探针,搜寻潜在靶点,预测其生物活性。结果按Fit score 由高到低排序 ......

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