王玉美 徐广峰 张琳欣 郑 君 杨 欣 张佩滢 林小飞

    微小RNA(microRNA, miRNA)是在真核生物中发现的一类内源性具有调控功能的非编码RNA，在物种进化中相当保守，其通过与靶标mRNA 3'UTR区结合，以抑制翻译或降解靶标mRNA，实现对基因表达的负调控作用。越来越多的研究已证实miRNA 的功能强大，它不但参与了多种生命活动，包括细胞内信号转导、细胞增殖、分化、凋亡、代谢、心脏发育、脑发育等，而且在多数疾病的发生发展过程中也发挥着重要作用[1-9]。本课题组在前期研究中，采用μParaflo?微流体芯片技术检测人脂肪组织miRNA 表达谱差异时，筛选出一条高表达于正常人脂肪组织、低表达于肥胖伴胰岛素抵抗患者脂肪组织中的miR-494-3p。为进一步开展miR-494-3p 的靶基因鉴定和功能研究，本文采用生物信息学的方法对miR-494-3p 进行靶基因预测，并对预测的靶基因集合进行基因本体(geneontology, GO)和生物学通路的富集分析。

    1 材料与方法

    1.1 靶基因预测

    应用miRNA 靶标基因数据库StarBase(https://starbase.sysu.edu.cn/)进行靶基因预测，得到有关miRNA-494-3p 的靶基因总数。此靶基因数据库集成了microT、miRanda、miRmap、PITA、RNA22、PicTar和TargetScan 共7 个传统常用的miRNA 靶标预测工具。选取miRanda、PITA 和Targetscan 3 个数据库预测结果的交集作为进一步分析的基因集合 ......