嗜酸热原体菌的超氧化物歧化酶的结构模建和进化踪迹分析
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摘要:为考察来源于极端高温酸性环境中的超氧化物歧化酶,建立了一个由嗜酸热原体菌的sod 基因编码的蛋白质的可靠三维分子结构,并对这个蛋白质进行进化踪迹分析识别出了11 个踪迹残基?其中,残基Asn39,Gly105 和Glu162 的位置随机遍布整个结构,其余的残基却全部都明显地聚于一个靠近铁原子的子类当中?由此从在三维结构确认sod基因编码含铁的超氧化物歧化酶。此外,那些被识别的靠近铁原子的踪迹残基可能跟铁的绑定和催化功能直接相关?
关键词:超氧化物歧化酶;嗜酸热原体菌;同源建模;进化踪迹分析;分子动力学
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