利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法探讨
MassArray分子量阵列技术平台,重亚硫酸盐测序,扩增效率
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王理 上官少方 马晓红 张霆 首都儿科研究所;
【摘要】目的:探讨利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法。方法:通过对不同扩增条件和扩增效率及不同条件处理的质谱分析比较了MassArray平台进行甲基化分析的特点。结果:本研究通过与重亚硫酸盐测序结果比较证实,MassArray分子量阵列技术平台能够反映甲基化修饰的真实水平;通过不同条件下PCR扩增效率与甲基化分析的结果,发现扩增效率是制约MassArray分子量阵列技术平台甲基化分析的关键因素,而产物的放置时间和不同的处理没有明显影响甲基化分析。结论:Mas-sArray甲基化分析平台是高效快速检测甲基化修饰的平台,在使用过程中应该根据实际的实验条件,进行合理的质控。
【关键词】 MassArray分子量阵列技术平台 甲基化 重亚硫酸盐测序 扩增效率
【基金】科技部973项目(2007CB511901) 国家自然科学基金(81000249/H0417) 北京市卫生局青年科学研究资助项目基金(2010-2012)
【分类号】Q75
前言近代生物学的迅猛发展及人类基因组计划(HGP)的初步完成,很多物种的基因组序列得以测定,现代生命科学研究进入后基因组时代,研究者关心的焦点由结构基因组学转向功能基因组学,表观遗传学的概念应运而生[1,2]。表观遗传修饰是遗传基因和环境表型间的联系桥梁,它扩展了经典
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前言
近代生物学的迅猛发展及人类基因组计划(HGP)的初步完成，很多物种的基因组序列得以测定，现代生命科学研究进入后基因组时代，研究者关心的焦点由结构基因组学转向功能基因组学，表观遗传学的概念应运而生。表观遗传修饰是遗传基因和环境表型间的联系桥梁，它扩展了经典遗传密码中所隐藏的信息。
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