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编号:1229290
Hsa-miR-204的生物学信息分析及研究进展
http://www.100md.com 2012年12月1日 中国医药生物技术 2012年第2期
癌基因,腺癌,基因组,1生物学分析,1miR-204的生物学信息分析,2miR-204的序列保守性分析,3Hsa-miR-204靶基因的筛选,2miR-204与肿瘤的关系,1作为抑癌基因,2作为癌基因,3miR
     韩泽平,黎毓光,何金花

    MicroRNA(miRNA)是一类由 21~25个核苷酸组成的非编码蛋白质的单链小分子 RNA,它们广泛存在于真核生物中,在物种进化中相当保守,其表达具有组织特异性和阶段特异性。miRNA 基因通常位于基因间或内含子区域,在核内由 RNA 聚合酶 II 转录产生具有帽子结构多聚腺苷酸尾巴的初级 miRNA(primary miRNA,Pri-miRNA)。Pri-miRNA 在核酸酶 Drosha和其辅助因子 Pasha的作用下被处理成由 70个核苷酸组成的前体 miRNA(precurosor miRNA,Pre-miRNA),经 Ran-GTP 依赖的核质转运蛋白Exportin-5 转运到细胞质中。另一个核酸酶 Dicer 将其剪切成约 22个核苷酸长度的miRNA 双链,其中一条为成熟的miRNA 分子。成熟的miRNA 分子在细胞内与Argonaute蛋白等形成 RNA 诱导的沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISC),并作用于特异 mRNA的3'UTR,从而抑制翻译过程或直接降解 mRNA[1]。研究表明,miRNA通过在转录或转录后水平调节一些信号分子来实现对细胞凋亡、增殖、分化、发育和新陈代谢等的调节[2]。随着研究的不断深入,越来越多的证据显示,miRNA的表达与肿瘤的发生、发展和预后密切相关[3],它既可扮演癌基因,也可扮演抑癌基因的角色,在肿瘤组织中表达上调的miRNAs可能起到癌基因的作用,表达下调的miRNAs 可能起到抑癌基因的作用,我们以 miR-204 为探讨重点,运用生物学软件对其生物学信息及可能的调控基因进行预测,为研究其在疾病发生与发展过程中的作用提供理论依据。

    1 生物学分析

    1.1 miR-204的生物学信息分析

    运用 UCSC和Ensembl 基因组在线浏览工具分析miR-204 在人类基因组中所处的位置,miR-204 定位于人类 9号染色体上 73424891-73425000 位置之间。成熟的单链 miRNA 分子序列为5' UUCCCUUUGUCAUCCUAUG CCU 3'(图 1)。

    1.2 miR-204的序列保守性分析

    我们利用 UCSC 基因组在线浏览工具分析发现,miR-204的成熟序列在人、小鼠、大鼠、大象和金鱼等脊椎动物中表现为高度保守(图 2)。 ......

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