临床样品中不同蚀斑表型单克隆轮状病毒VP8基因序列分析
血清型,1材料与方法,2结果,3讨论
钱雯,马波,黄永坤,陈敏,王丽丽,张益丽,杨晨,徐道俊,刘馨临床样品中不同蚀斑表型单克隆轮状病毒VP8基因序列分析
钱雯,马波,黄永坤,陈敏,王丽丽,张益丽,杨晨,徐道俊,刘馨
作者单位:650106 昆明,云南沃森生物技术股份有限公司(钱雯、马波、陈敏、王丽丽、张益丽、杨晨、徐道俊、刘馨);650032 昆明医学院第一附属医院(黄永坤)
轮状病毒属于呼肠孤病毒属,为没有包膜的双链 RNA病毒,人畜禽共患,其感染每年引起约 50 万婴幼儿死亡[1]。
宿主细胞表面的寡糖分子是一个重要的因子,它们与轮状病毒和细胞的相互识别及吸附有关,同时还影响了病毒的宿主特异性[2]。研究表明,轮状病毒外壳蛋白 VP4 的糖类结合区域位于 VP4 的亚基 VP8,其与细胞表面寡糖分子的相互作用使病毒识别并吸附到细胞表面。轮状病毒对细胞的感染是通过 VP8 与细胞表面多糖,尤其是与内部唾液酸(N-acetyl- and N-glycolylneuraminic acids,Sia)的结合完成的[3]。人株、猴株以及猪轮状病毒 VP8 基因序列在识别细胞表面唾液酸或其衍生物甲基-α 二氮乙酰神经氨酸的位点有显著的差异[1],影响病毒在细胞培养上的敏感性和适应性。
研究发现,分离自猪粪便的轮状病毒在 157 位呈现出Pro 或者 Ser 的多态性;牛轮状病毒株 NCDV 随细胞培养的适应,VP8 基因 157 位由 Pro 突变为 Ser,从而产生了NCDV Cody 和 NCDV Lincoln 两个衍生亚株,这是在VP8 氨基酸 64 ~ 224 区域内发生的唯一的氨基酸突变[4]。分离自人粪便样品轮状病毒的 VP8 基因是否存在上述位点的多态性?
轮状病毒感染细胞后可形成蚀斑,在凝胶的固定下,病毒颗粒不能自由地移动,在一个病毒颗粒进入细胞并产生子代病毒的过程中,细胞死亡并形成蚀斑,一个蚀斑代表了一个单克隆的病毒分子。蚀斑的表型,即蚀斑的大小与病毒感染后产生细胞致病作用(cytopathogenic effect,CPE)的时间和程度有关,蚀斑较大的病毒克隆产生 CPE 的时间较快,也较为剧烈。VP8 基因序列的差异与空斑的大小即蚀斑表型、病毒分子的感染性之间存在怎样的关系?
为了回答上述问题 ......
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