白血病染色体MLL基因断裂(易位)FISH探针的研究
孙江漫,胡林萍,李承文,陆宏卿,薛卫霞,程涛,缪为民白血病染色体基因断裂(易位)FISH探针的研究
孙江漫,胡林萍,李承文,陆宏卿,薛卫霞,程涛,缪为民
目的 自主研制可以检测白血病染色体基因断裂的双色 FISH 检测试剂盒。方法 根据染色体基因图谱,选定合适的 BAC 克隆重叠群分别作为基因断裂点 5' 端探针和 3' 端探针。采用缺口平移法,制作出 5' 端标记绿色荧光素,3' 端标记红色荧光素的探针。用双盲法检测白血病临床样本 40 例,对自制探针和同类进口探针在各项技术参数上进行对比研究。结果 自制探针检测基因断裂(易位)的阴、阳性率与同类进口产品完全相符;在 Spectrum Green 和 Cy3? v1 通道中,自制探针的平均荧光信号强度比进口探针明显提高(自制探针分别为:2930.5 ± 38.00,2766 ± 59.54;进口探针分别为:2239 ± 45.13,1986 ± 59.56;1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 主要试剂及仪器 质粒纯化试剂盒购于德国 Qiagen 公司;R I、ssDNA、tRNA 购于美国 Sigma 公司;DNA polymerase I、人 cot-DNA、SSPE 购于美国 Invitrogen 公司;Spectrum Green-dUTP 购于美国 Abbott Molecular 公司;PromoFluor-555-dUTP 购于美国 PromoKine 公司;进口探针购于美国 Vysis 公司。Axioimager Z2 型荧光显微镜为德国Carl Zeiss 公司产品;ThermoBrite 原位杂交仪为美国Abbott Molecular公司产品。
1.1.2 标本来源 选择在本院就诊的血液病患者骨髓样本。
1.2 方法
1.2.1 制片过程 取骨髓样本,用 0.075 mol/LKCl 低渗去除红细胞,细胞甩片后用甲醇室温固定过夜,第 2 天用 2% 甲醛固定 5 min 后,储存于–20 ℃ 70% 乙醇中,使用时依次在 70%、85%、100% 梯度乙醇中脱水,晾干后 FISH 检测备用。
1.2.2 探针设计 使用 UCSC Genome Bioinformatics 数据库定位检索细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome,BAC)克隆[6]。选择定位于 11q23 包含基因断裂点 5'端的 BAC克隆重叠群(图 1,包括 3 个 BAC 克隆) ......
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