周嘉彬，吕钰冰，韩泽平，何金花，黎毓光，朱剑霞

    生物信息学分析mircoRNA在乳腺癌中的调控网络

    周嘉彬，吕钰冰，韩泽平，何金花，黎毓光，朱剑霞

    生物信息学是指综合应用信息科学、数学的理论、方法和技术来管理、分析和利用生物分子数据的一门科学。科学地利用生物分子数据及其分析结果，可以大大提高研究和开发的科学性及效率[1]。miRNA(mircoRNA)是一类由内源基因编码的长度为 20 ~ 24 个核苷酸的非编码单链小分子 RNA。miRNA 能够与靶信使 RNAs(mRNAs)3'-端非翻译区(3'-UTR)互补配对，阻碍 mRNA 翻译或使其稳定性降低而被降解，从而参与到转录后调控[2]。近年许多研究表明，miRNA 在肿瘤的发生发展中起着重要的作用[3-4]。乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一，是发达国家中引起女性死亡的第二大癌症(在发展中国家位居第一)[5]。已有大量文献报道，多种 miRNAs 在乳腺癌的发生、发展及肿瘤的治疗过程中发挥着重要的作用[6-8]。因此，探讨 miRNA 在乳腺癌细胞中的分子调控机制，能够为抗癌策略提供新的思路。

    1 材料与方法

    1.1 材料

    目前生物学信息软件分为单机分析软件、在线分析软件和生物学数据库，利用生物信息学软件能够提示、指导、替代实验操作，利用对实验数据的分析所得的结论设计下一阶段的实验，本次论文所用到的生物学信息软件如下：

    ①人类 miRNA 疾病数据库(HMDD v2.0，http://www. cuilab.cn/hmdd)

    ②miRwalk 2.0(http://zmf.umm.uni-heidelberg.de/apps/ zmf/mirwalk2/)

    ③PubMed(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed)

    ④lncRNA 疾病数据库(http://www.cuilab.cn/ lncrnadisease)

    ⑤starBase v2.0(http://starbase.sysu.edu.cn/)

    ⑥TransmiR(http://www.cuilab.cn/transmir)

    ⑦Cytoscape 软件

    1.2 方法

    1.2.1 通过 HMDD v2.0 查询已证实与乳腺癌相关的 miRNAs，并将所有 miRNAs 进行汇总，筛选出有 14 篇或以上文献报道与乳腺癌相关的 miRNAs 作为研究对象 ......