赵子骞，梁新苗，张飞跃，赵培庆

    基于生物信息学技术探讨宫颈癌肿瘤组织中p53突变、共表达网络及临床转归分析

    赵子骞，梁新苗，张飞跃，赵培庆

    255036 山东，淄博实验中学(赵子骞、梁新苗)；255036 山东，淄博市中心医院妇科(张飞跃)，转化医学中心(赵培庆)

    利用生物信息学技术探讨 p53 在宫颈癌的突变、共表达网络及在疾病预后中的预测能力，为宫颈癌的诊断与预后判断提供一定的理论基础。

    利用癌症基因组图谱数据库对靶标分子 p53 进行检索，发现其突变及可能的作用分子与网络。

    p53 基因在宫颈癌中的突变率约为 9%，通过 STRING 在线数据库找到在宫颈癌中与 p53 互作分子 Bcl2，p53 的表达水平与宫颈癌预后呈正相关。

    本研究发现了与 p53 共同发挥生物学功能的相关分子 Bcl2，为宫颈癌的早期诊断、靶向治疗及预后判断提供了一定理论基础。

    宫颈癌； p53； Bcl2； TCGA数据库； 生存期

    宫颈癌虽然可以早期预防，但仍然是癌症相关死亡的主要原因之一，也是位于女性发病率第二的恶性肿瘤。它占全球女性肿瘤相关死亡人数的10% ~ 15%，每年约有 527 600 例新发病例及265 700 例死亡病例[1-2]。虽然超过 90% 的早期阶段宫颈癌可接受标准化治疗从而达到临床治愈标准，但对于晚期宫颈癌患者，特别是已经发生转移的病人预后较差[3-4]。因此，早期准确诊断宫颈癌，发现新的治疗靶点，可大大提高宫颈癌患者生存率及预后水平。

    近年来基因芯片技术已被广泛应用于筛选表达基因组中变化较大的基因分子，通过该技术可找到与肿瘤发生发展相关的基因分子、基因表达与通路乃至临床转归情况。p53 基因是目前已知与肿瘤发生相关性最高的基因，有趣的是，大部分肿瘤组织中表达突变型 p53，而在宫颈癌中 p53 主要是野生型[5]。众所周知野生型 p53 一般起抑癌基因功能，而突变型p53 主要起癌基因功能。因此本研究中，课题组在癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)数据库中利用生物信息学技术，对 297 例宫颈癌病人基因表达谱及 p53 突变情况进行深入分析，同时利用KM plotter 网上分析工具分析 p53 表达与疾病预后生存期的关系，以获取宫颈癌组织中 p53 突变及与p53 相关的差异表达基因，从而为宫颈癌的早期诊断和靶向治疗提供候选生物学标志物。

    1 材料与方法

    1.1 基因芯片数据来源 ......