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编号:1223542
果糖诱导斑马鱼肝脏脂肪变性的转录组学分析
http://www.100md.com 2019年8月20日 中国医药生物技术 2019年第4期
幼鱼,1材料,2方法,3统计学处理,2结果,1果糖诱导斑马鱼幼鱼肝脏脂肪变性,2测序数据统计,3差异基因表达分析,4差异基因KEGG和GO归类分析,5Real-timePCR分析PPAR通路差异基因,3讨论
     陈博,张靖溥

    果糖诱导斑马鱼肝脏脂肪变性的转录组学分析

    陈博,张靖溥

    100050 北京,中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所药理室/卫生健康委员会抗生素重点实验室

    非酒精性脂肪肝(NAFLD)的发病呈低龄化趋势,本研究旨在建立一种模拟低龄人群的高糖诱导的 NAFLD 模型,揭示其基因表达谱特征,为疾病的机制研究和药物筛选提供基础。

    采用高果糖饮食诱导斑马鱼产生肝脏脂肪变性,油红 O 染色分析肝脏脂肪变性率,组织病理学方法观察肝脏脂质堆积,并分析肝脏生化指标变化。利用转录组测序观察基因表达谱变化,通过基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体(GO)数据库进行差异基因功能富集,分析其可能影响的信号通路与生物过程。

    斑马鱼幼鱼高果糖喂养 10 d 后发生肝脏脂肪变性,肝脏切片 HE 染色和油红 O染色结果发现,果糖喂饲的幼鱼肝脏出现微小脂质空泡,呈大面积红色着色。肝脏甘油三酯、葡萄糖含量显著高于正常对照组。经转录组测序发现果糖喂饲的幼鱼肝脏表达谱发生明显改变,共发现 485 个差异表达基因(变化倍数 > 3,1 材料与方法

    1.1 材料

    AP100 幼鱼饲料购自美国Zeigler Bros 公司;总胆固醇、甘油三酯、葡萄糖检测试剂盒购自北京普利莱科技有限公司;Trizol 试剂盒购自美国 Invitrogen 公司;SZX10 型显微镜购自日本Olympus公司;RM2255 型石蜡切片机和CM1950型冰冻切片机均购自德国Leica 公司;LightCycler 96 荧光实时定量 PCR 仪购自瑞士Roche公司。

    1.2 方法

    1.2.1 斑马鱼饲养 AB 系斑马鱼,饲养温度(28.5 ± 1)℃,14 h 光照/10 h 黑暗循环。斑马鱼胚胎培养至受精后5 d(5 dpf),给予不同饮食喂饲:对照组给予 30 mg/d AP100,果糖组给予 30 mg/d AP100 和 0.25%(w/v)果糖,从 5 dpf 继续培养至 10 dpf。所有斑马鱼在实验结束前禁食过夜。

    1.2.2 斑马鱼整体油红 O 染色 参考文献[6]的方法,斑马鱼浸泡在 4% 多聚甲醛中固定过夜,PBS 清洗两次 ......

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