聂璐，吴奎海，陈文静，李炜煊

    插入序列IS6100介导DNA序列转移的机制研究

    聂璐，吴奎海，陈文静，李炜煊

    528000 广东，佛山市第一人民医院检验科

    插入序列 IS6100 与耐药基因转移密切相关，本研究旨在初步探究 IS6100 转移 DNA 序列的机制。

    以 Genbank 库中已有序列中含两个及两个以上拷贝 IS6100 序列的质粒或者染色体为研究对象，通过生物信息分析的方法分析各 IS6100 侧翼的靶位点重复序列(TSD)，推测该元件转座酶可能的工作机制。

    共检索到 22 条序列，含 5 条染色体、16 条质粒以及 1 条定位未知的转座子序列。其中有 13 条序列(59%)来自鞘脂菌属细菌，余下均来自条件致病菌的染色体或质粒。在鞘脂菌属细菌 TKS 中，IS6100 拷贝数可多达 29 个，且 IS6100 和鞘脂菌属细菌基因组的 GC% 均接近 60%。共有 35 条不同的 8 bp TSD 在这些菌株中出现的频率为 2 ~ 8 次。TSD 的 GC% 含量在 13% ~ 100%，有 87%(30/35)的 TSD 序列 GC% 含量均≥ 50%。这些 TSD 可同时出现在同一菌株的染色体或质粒内部、同一菌株的染色体和质粒之间、不同菌株的染色体和质粒间。

    IS6100 的产生菌可能为鞘脂菌属细菌。IS6100 的作用靶位点没有高度选择性，但仍倾向作用于高GC% 含量位点。两个 IS6100 可以形成复合转座子，转移其间的 DNA 序列，这些转座事件可以发生在分子间和分子内。

    DNA 转座子； 基因转移，水平； IS6100； 耐药机制

    耐药基因的转移总是与各种可转移元件相关(mobile genomic elements，MGEs)，这其中包括质粒、复合转座子、单元转座子、可整合可接合元件和插入序列(insertion sequence，IS)等[1]。插入序列本身不含耐药基因，但是它编码一个或多个转座酶。绝大多数插入序列末端都有反向重复序列(terminal inverted repeats，TIRs)，大小为10 ~40 bp。依据TIRs 在转座酶的上游还是下游细分为 IRL(inverted repeat left)和 IRR(inverted repeatright)。TIRs 提供了插入序列转座酶的识别和结合位点，参与序列剪切和转移的过程[2]。

    随着越来越多细菌基因组被解析，插入序列与耐药基因的关系也逐渐明晰。有些耐药基因一般位于插入序列的下游 ......