CRISPR系统相关蛋白的纯化与活性分析
底物,外源,质粒,1材料与方法,2方法,2结果,1蛋白的表达与纯化,2浓度测定,3Cas3酶活验证,4Cas6酶活验证,5Cas9酶活验证,3讨论
田东芳,崔香玲,周睿,张永欣,马雪梅,岑山·论著·
CRISPR系统相关蛋白的纯化与活性分析
田东芳,崔香玲,周睿,张永欣,马雪梅,岑山
100124 北京工业大学生命科学与生物工程学院(田东芳、马雪梅);100050 北京,中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所免疫室(田东芳、崔香玲、周睿、张永欣、岑山)
对 CRISPR 相关蛋白 Cas3、Cas6 及 Cas9 进行表达纯化,并测定其活性。
在体外构建带有目的基因的质粒,导入大肠杆菌表达系统,通过大肠杆菌的过表达,裂解并提取蛋白,利用 His 标签,可将目的蛋白纯化出来;通过 3 种 Cas 蛋白对不同核酸的切割,分别设计 3 种核酸底物,再通过聚丙烯酰胺凝胶电泳,最终确定 Cas 蛋白的活性。
成功表达并纯化得到 Cas3、Cas6 及 Cas9 3 种蛋白,并根据其蛋白特性,与相应的核酸底物进行孵育,在电泳后通过凝胶成像,可观察到 3 种蛋白均具有活性。
表达纯化的 Cas3、Cas6 及 Cas9 具有生物学功能,为其功能机制研究奠定了基础。
CRISPR; Cas3; Cas6; Cas9
规律间隔成簇短回文重复序列及相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR associated proteins,CRISPR-Cas)是细菌和古生菌用来抵抗外源核酸的适应性免疫系统[1]。CRISPR 位点是由细菌自身的重复序列及用于识别外源核酸的间隔序列组成。CRISPR 免疫系统执行功能,需要经历 3 个阶段:适应、表达及干扰。在适应阶段,细菌将来源于噬菌体或者外源质粒的核酸序列作为间隔序列,整合到 CRISPR 位点的重复序列之间。这些间隔序列执行序列记忆功能,以保证在之后的相应噬菌体或质粒的入侵过程中进行针对性的防御[2]。在表达阶段,所有重复序列和间隔序列作为一个整体,被转录成 crRNA 前体,最终被相应 Cas 蛋白处理成成熟的 crRNA[3]。在干扰阶段,crRNA 作为向导,与入侵的核酸互补配对,同时由相应的 Cas 蛋白进行识别以及切割外源入侵核酸[4]。
根据基因组成、Cas 蛋白与基因结构之间的序列相似性,目前将 CRISPR 系统分为两类(1 类和 2 类),其中 1 类中包含 3 种型别(I 型、III 型和 IV 型),2 类中也包含 3 种型别(II 型、V 型和 VI 型)以及 19 个亚型[5] ......
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