王珊珊，石继春，杜宗利，石刚，龙新星，徐颖华，叶强

    ·论著·

    乳酶生生产用菌种的全基因组序列分析研究

    王珊珊*，石继春*，杜宗利，石刚，龙新星，徐颖华，叶强

    102629 北京，中国食品药品检定研究院卫生部生物技术产品检定方法及其标准化重点实验室

    了解我国乳酶生的生产用菌种全基因组分子特征。

    将乳酶生的生产用菌种屎肠球菌 CMCC32901 培养后，依次进行形态观察、生化鉴定与 16S rRNA基因序列测定，并应用高通量测序技术，对生产用菌种 CMCC32901 进行全基因组序列测定，分析基因组基本特征、基因功能、同源性及致病性。

    分析结果显示，发现 CMCC32901 菌株与 NCBI 数据库中收录的不同屎肠球菌菌株的 16S rRNA基因序列相似度大于 99.5%，与其他肠球菌菌株之间的 16S rRNA 基因序列相似度均大于 92.0%。屎肠球菌 CMCC32901 染色体全基因组序列全长为 2 394 726 bp，平均 GC 含量为 39.1%，共含有 2718 个基因，其中具有 COG 功能 2059 个，参与 KEGG 代谢通路 1402 个。同源性分析显示其基因组中编码 2589 个屎肠球菌特异性蛋白。细菌的致病性预测分析发现在 CMCC32901 菌株中发现 5 种对人潜在致病性相关蛋白。

    首次获得了我国乳酶生生产用菌种——屎肠球菌 CMCC32901 全基因组的基本特征，为后续乳酶生的生产工艺优化和生产用菌种的质量控制奠定了基础。

    乳酶生； 屎肠球菌； 生产用菌种； 全基因组序列； 质量控制

    乳酶生是一种含有屎肠球菌的传统活菌制剂，主要利用其所含的活菌可在宿主肠道内分解糖类生产乳酸，使肠道内酸度增高，从而抑制肠道内其他一些菌群的生长繁殖。在临床上乳酶生作为助消化药，广泛用于肠内异常发酵引起的肠胀气，消化不良引起的腹泻等症状[1]。在国家药监局数据库查询发现，当前在全国范围内有近 20 家生产企业获得批准文号 36个，生产不同剂型的乳酶生。

    生产用菌种是药品研究、生产和检定的物质基础，其质量直接与药物终产品安全和有效性密切相关[2]。目前在 2020 版《中国药典》二部“乳酶生”专论和三部“微生态活菌制品总论”中对乳酶生的生产用菌种质量控制主要包括形态观察、培养特性、产酸活性和安全性等比较传统的方法，缺乏菌株水平的分子特征方面的评价[3-4]。此外，我国乳酶生的生产用菌种 CMCC32901(原编号：140623)自 20 世纪 50 年代用于生产以来 ......