Tn1548相关区域在不同种属临床分离菌中多态性及armA跨种属转移可能的机制
转座子,质粒,元件,1材料与方法,2方法,2结果,1标准Tn1548的结构特点,2Tn1548-like转座子的结构特征,3讨论,1标准Tn1548与armA基因迁徙过程间的关联
·论著·Tn相关区域在不同种属临床分离菌中多态性及跨种属转移可能的机制
聂璐,吴奎海,陈平熹,杨汉才,李炜煊
528000 广东,佛山市第一人民医院检验科(聂璐、吴奎海、李炜煊);527200 广东,罗定市人民医院检验科(陈平熹、杨汉才)
复合转座子 Tn一直被认为介导了基因的转移,本研究通过分析基因在不同种属的基因环境,提出基因转移的可能机制。
以 GenBank 库不同种属细菌中已经发现的含有 Tn及 Tn-like 转座子为研究对象,通过生物信息学技术比较分析基因环境的差异,结合基因环境中各种插入元件的工作机制,推测基因跨种属转移的可能机制。
一共有 11 条含有 Tn或者 Tn-like 的全质粒序列纳入分析。这些质粒序列来自不同种属,包括鲍曼不动杆菌、肠杆菌科细菌、铜绿假单胞菌。除鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌的质粒类型的不相容组别未知外,其他种属来源的质粒不相容组别涉及 IncU、IncFII(Yp)、IncN、IncL/M、IncL/M、IncA/C2和 IncR 嵌合型,IncA/C、IncFIIK和 IncT。上述结果强烈的提示基因的跨种属转移不是质粒的广泛播散而更可能是转座子或者更小的可移动元件参与其中的事件。进一步对 Tn、Tn-like 转座子及 Tn相关区域的分析发现了基因在转移中侧翼的相对保守区是 IS--IS结构。
结合 IS和 IS元件的工作机制,推测 IS--IS结构极有可能介导了基因在不同种属的广泛播散。
Tn;基因; 氨基糖苷类; 碳青霉烯类; 耐药机制; 跨种属转移机制
细菌耐药性的产生和广泛播散是当前人类健康面临的最重大的挑战之一,是全球公共卫生领域中迫切需要采取行动的重要问题。随着临床医疗和畜牧养殖领域大量无节制地使用甚至滥用广谱抗生素,细菌在抗生素压力选择下也不断地进化产生新的、功能更为强大的耐药酶以适应环境需要。16S rRNA 甲基化酶 ArmA 由基因编码,它能甲基化 16S rRNA A 位点内部的特定位点,使氨基糖苷类抗生素失去与其靶点(核糖体 30S 亚基)结合的能力,从而丧失后续抑制细菌蛋白质合成的效力。该酶不水解药物,而是保护细菌自身免受药物的攻击。ArmA 介导细菌对所有临床一线使用的氨基糖苷类抗生素包括阿米卡星、妥布霉素和庆大霉素等耐药且均为高水平耐药(最小抑菌浓度 MIC > 1024 μg/ml)[1]。
2003 年,基因首次在肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌中检出[2-3]。迄今基因已呈现在全球范围内和不同种属细菌间广泛播散的态势 ......
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