NDM-1抑制剂研究进展
美罗培南,衍生物,1NDM-1的结构及催化机制,2NDM-1抑制剂的研究现状,1与锌离子相互作用的抑制剂,2与氨基酸残基相互作用的抑制剂,3同时作用于锌离子和氨基酸残基的抑制剂,4抑制NDM-1表达的抑制剂,5机制尚不明确的抑制剂,3
王倩,刘忆霜·综述·
NDM-1抑制剂研究进展
王倩,刘忆霜
100050 北京,中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所国家新药(微生物)筛选实验室
抗生素的发现是人类抵御细菌感染性疾病的重大突破。然而随着抗生素的广泛使用和滥用,细菌多药耐药问题日益严峻,对人类健康构成了巨大的威胁。碳青霉烯类抗生素一度被视为革兰氏阴性菌感染的“最后一道防线”,但随着碳青霉烯酶的出现,碳青霉烯耐药的革兰氏阴性菌(如大肠杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌)在全球范围内快速蔓延,为临床治疗带来了新的挑战[1-3]。
新德里金属-β-内酰胺酶-1(New Delhi metallo-β-lactamase-1,NDM-1),属于 B1 类金属β-内酰胺酶(metallo-β-lactamases,MBLs),自 2008 年首次被报道以来,NDM-1 因其广谱耐药作用(可水解除单环 β-内酰胺类以外所有的 β-内酰胺类抗生素)、变异体的多样性(通过不同位置的氨基酸发生突变进化出的新变种已达 24 个)、可转移性(编码基因NDM-1 可通过质粒迅速传播)而备受关注[2, 4-6]。表达 NDM-1 的菌株可引起尿道感染、肺部感染、败血症等多种疾病,但临床治疗结果显示,以表达 NDM-1 为特点的“超级细菌”仅对黏菌素、替加环素、磷霉素等少量抗生素敏感[2, 4, 7]。因此,寻找低毒高效的 NDM-1 抑制剂是研究者们亟待解决的重大科学问题。
1 NDM-1 的结构及催化机制
NDM-1 具有典型的 αβ/βα 夹层结构,其活性中心包含两个由氢氧根桥接的二价锌离子:Zn1(与氨基酸His120、His122、His189配位)和 Zn2(与氨基酸Asp124、Cys208、His250配位)[4]。NDM-1 的催化机制尚无明确定论,部分学者认为其遵循双锌催化机制,主要假说为:底物通过羰基氧原子与 Zn1 配位、内酰胺氮原子与 Zn2 配位来极化内酰胺键,亲核的羟基攻击底物羰基碳,形成过渡态复合体,最终导致 C-N 键的断裂,内酰胺氮原子以阴离子的形式被释放,Zn2 作为超强酸提供质子使其稳定[8]。
2 NDM-1 抑制剂的研究现状
目前文献报道的 NDM-1 抑制剂高达 500 多个[4],根据作用机制可大概分为三类:第一类抑制剂直接作用于 NDM-1 活性部位的锌离子,如金属离子螯合剂三(2-吡啶基甲基)胺[tris(2-pyridylmethyl)amine ......
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