肿瘤患者数字荧光分子杂交技术基因检测复测原因分析
点数,白细胞,计数,1材料与方法,2方法,3统计学处理,2结果,1一般资料,2基因位点复测情况,3基因检测复测情况与患者基本特征的关系,4基因检测复测位点个数与复测原因的相关性,5不同采血时间白细胞计数与基因检
白羽,马旭,张艳华·技术与方法·
肿瘤患者数字荧光分子杂交技术基因检测复测原因分析
白羽,马旭,张艳华
100142 北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所药剂科,恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室
药物基因组学(pharmacogenomics,PGx)是基于人类遗传多样性,在药物治疗中具有预测药物疗效和不良反应的作用。通过检测特定的 PGx 生物标志物,临床医生能够更好地预测哪些患者可能发生严重不良反应和(或)疗效不佳治疗,为医生临床决策提供参考依据[1-3]。对于多数基因检测研究,研究者多采用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)联合 Sanger 法或焦磷酸对药物代谢酶或药物作用靶点进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)检测[4]。但是进行 PCR 对实验室要求较高,需要相应的实验室资质和认证。此外,传统的测序技术存在着处理量低、成本高、操作困难等缺点,限制了其在实验室诊断中的广泛应用[5]。然而杂交测序不需要高通量测序,也不受 PCR 实验室条件的限制,数字荧光分子杂交技术(digital fluorescence molecular hybridization,DFMH)是基于荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)发展起来的一种新技术。荧光团偶联特异的脱氧核糖核酸(DNA)作为探针杂交到互补序列上。FISH 探针的设计包括两个荧光团,一个作用于染色体靶区特定的 SNP,另一个作用于同源染色体的特定 SNP,其分别对两个染色体进行差异性标记,通过荧光检测系统进行分析[6]。目前国内大部分医院采用 DFMH 进行 SNP 检测。
DFMH 进行 SNP 检测过程中需要收集白细胞,部分患者会因出现信号低或峰型差而进行复测。目前国内外尚无复测原因分析文献,而我院属于肿瘤专科医院,发现进行标准的放化疗等肿瘤常规治疗方案后会导致骨髓抑制,降低白细胞数量,因此本研究旨在探索患者体内白细胞水平或患者基本特征是否是导致 DFMH 复测的原因 ......
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