冷缺血时间与胆道闭锁肝组织RNA质量的相关性分析
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马婷婷,曹磊,王建喜,毕森盛,段可然,冯湛,毕博文,王政禄,郑虹·论著·
冷缺血时间与胆道闭锁肝组织RNA质量的相关性分析
马婷婷,曹磊,王建喜,毕森盛,段可然,冯湛,毕博文,王政禄,郑虹
分析冷缺血时间与胆道闭锁肝组织样本中 RNA 浓度、纯度及完整性(RIN)的相关性,为获得高质量肝组织样本提供标准。选取天津市第一中心医院 30 例因胆道闭锁行肝移植术患者的肝组织,室温放置 0、0.25、0.5、1、2、3、5 和 12 h 后分别加入 RNAlater,4 ℃过夜,提取总 RNA,检测 RNA 浓度、纯度及 RIN 值,根据浓度计算出产量,运用单因素方差分析分析冷缺血时间与胆道闭锁肝组织样本中 RNA 产量、纯度及 RIN 值的相关性,典型相关分析分析不同冷缺血时间后组织样本 RNA 产量、纯度及 RIN 值之间相关性。组织样本冷缺血 0、0.25、0.5、1、2、3、5 和 12 h 后,每10 mg 组织样本的RNA 产量分别是(9.123 ± 0.530)、(9.220 ± 0.606)、(9.000 ± 0.862)、(9.067 ± 0.498)、(9.027 ± 0.523)、(9.143 ± 0.627)、(9.113 ± 0.446)和(9.193 ± 0.492)μg(= 0.78)。RNA 纯度的比值分别为1.914 ± 0.065、1.896 ± 0.060、1.904 ± 0.053、1.907 ± 0.057、1.896 ± 0.057、1.888 ± 0.050、1.908 ± 0.060 和 1.899 ± 0.059(= 0.74)。RIN 值分别为9.077 ± 0.104、8.777 ± 0.138、8.650 ± 0.187、8.197 ± 0.188、7.963 ± 0.227、7.597 ± 0.301、4.433 ± 0.272 和 3.747 ± 0.236(= 0.000)。单因素方差分析显示冷缺血时间与 RNA 的产量和纯度均无相关性,与 RIN 值显著相关。典型相关分析显示不同冷缺血时间后组织样本 RNA 产量与纯度、产量与 RIN 值及纯度与 RIN 值之间均无相关性。冷缺血时间与胆道闭锁肝组织 RNA 质量具有显著相关性,缩短冷缺血时间可获得高质量 RNA。
冷缺血时间; 胆道闭锁; 肝组织; RNA 质量; RNA 完整性
组织样本是临床诊断和科学研究中应用广泛的生物样本资源之一,组织质量的评估主要从 DNA、RNA、蛋白质及形态学等方面进行评价 ......
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