王永华杨 凌

    (1西北农林科技大学生命科学学院生物信息学中心，西安，712100；2中国科学院大连化学物理研究所药用资源开发研究组，大连，116023)

    基于系统药理学的现代中药研究体系

    王永华1杨 凌2

    (1西北农林科技大学生命科学学院生物信息学中心，西安，712100；2中国科学院大连化学物理研究所药用资源开发研究组，大连，116023)

    由于系统生物学的高速发展，以及系统生物学对现代药理学领域的深刻影响，近年来正在形成一个新兴的、跨学科分支，即系统药理学(Systems Pharmacology)。然而系统药理学无论在理论和方法上均不成熟。尤其是，如何将系统药理学的思想和理论用于中药研究尚缺乏探索性工作。本文将综述当前系统药理学的最新进展，同时结合研究者的实践，重点介绍如何将药效学、药动学以及网络、组学以及系统分析综合起来，形成一个统一的完整的、可供开展中药药理学、药效学的预测和验证研究的系统模型。从而为从系统水平研究和分析中药和机体的相互作用，以及新药开发、靶点发现、新的治疗策略等提供新的研究方法。文章最后介绍了研究者最新开发的中药系统药理学数据库和分析平台软件。

    系统药理学；网络药理学；系统生物学；中药

    1 引言

    高通量测序技术，质谱分析、NMR谱以及组学技术的高速发展为药物靶点发现提供了其所未有的技术支持，深刻地影响了我们对药物药效、药动学和药物毒性的认识手段和评价标准，从而为新药开发提供了重要契机。为了应付“数据爆炸”和解决复杂生物问题的需要，生物学家、药物学家等不断向数学和计算机专家求救。从而导致产生以计算为基础工具的生物信息学、计算生物学、药物信息学、系统生物学，网络药理学以及刚刚兴起的系统药理学等新兴学科。

    就目前来说，系统药理学还没有确定的定义，从不同的角度和侧重点其定义会不同。美国NIH于2011年10月年举办的系统药理学研讨会为此开展了初步的讨论。专业学者认为系统药理学是系统生物学技术推动下的经典药理学的延伸(或重新发现)[1]。该学科的定义往往和工程学以及药理学相关“定量分析药物和一个生物系统间的动力学相互作用。其目的是为了从整体了解系统的行为，而不是从个体行为来了解”[2]。而产业界则认为“系统药理学”分析和药效动力学(PD)以及药代动力学(PK)建模联系紧密[3]，这种复杂的生理过程涉及药物的分布和作用，被简单地用一系列存在相互联系的“黑厢”所模拟。鉴于目前的认识水平和发展成果，我们给系统药理学给出如下定义。

    2 系统药理学概念 ......