三黄汤治疗2型糖尿病的分子机制研究(2)
1 资料与方法1.1 资料
1.1.1 三黄汤化学成分 基于中药系统药理学分析平台(TCMSP)在Herb name中进行查找黄连、黄芩、大黄的化学成分[8-9]。基于CTD(http://ctdbase.org/)筛选T2DM的靶标基因。参照Lipinski′s五规则,选择同时满足-2≤ALogP≤5,OB≥50%,DL≥0.18,MW≤500筛选三黄汤有效化学成分。
1.1.2 靶点分子功能 基于DAVID6.8生物信息学数据,该数据库可以对靶标蛋白或基因进行分子功能、生物过程、细胞成分等分析。
1.1.3 基因相互作用 STRING(https://string-db.org/),將2型糖尿病(Diabetes Mellitus,Type 2)中的30个基因输入到STRING中,对30个基因之间的相关性进行分析。
1.1.4 分子对接 iGEMDOCK操作相对比较简单,而且对接范围比较广,也可以用于金属对接。
1.2 方法
1.2.1 三黄汤化学成分筛选 相关参数设置为口服生物利用度(Oral Bioavailability ......
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