16S rRNA高通量测序研究柴芪汤对代谢综合征大鼠肠道菌群的影响
彭龙 张立平


摘要 目的:采用16S rRNA高通量测序技术分析柴芪汤对代谢综合征(MS)大鼠肠道菌群的影响。方法:通过Illumina Miseq PE300型高通量测序仪对大鼠粪便肠道菌群进行16S rRNA基因V3-V4可变區检测,运用Usearch、Mothur、LEfSe分析肠道菌群的组成结构及不同菌属相对丰度变化。结果:柴芪汤能够逆转MS大鼠肠道菌群物种多样性的下降,并纠正MS导致的菌群组成结构改变。研究发现MS大鼠的肠道菌群在菌属水平有57个菌属相对丰度发生显著变化,而柴芪汤能将其中的54个菌属恢复至正常水平。结论:从肠道微生态角度阐释了MS的可能病机,柴芪汤可以通过调节肠道菌群防治MS。
关键词 代谢综合征;柴芪汤;健脾疏肝;肠道菌群;16S rRNA高通量测序;炎症反应;短链脂肪酸;脂多糖
Effects of Chaiqi Decoction on Gut Microbiota in MS Rats Based on 16S rRNA
High-Throughput Gene Sequencing Study
PENG Long,ZHANG Liping
(Beijing University of Chinese Medicine,Beijing 100029,China)
Abstract Objective:To explore the effects of Chaiqi Decoction on gut microbiota in metabolic syndrome rats based on high-throughput 16S rRNA gene sequencing.Methods:Illumina Miseq PE300 high-throughput sequencer was used to detect the 16S rRNA gene V3-V4 variable region of rat fecal intestinal flora.Usearch ......
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