基于网络药理学和分子对接研究丁香抗流感的作用机制
流感病毒,1资料与方法,2结果,3讨论
何紫凝 袁中文 冯森玲(广州医科大学附属第三医院药学部/广东省产科重大疾病重点实验室,广州,510150)
据美国疾病预防控制中心预测报告,自2019年10月至2020年4月有3 900~5 600万人感染流感,导致24 000~62 000人死亡[1]。流行性感冒(流感)是一种由流感病毒感染导致的急性呼吸道传染病,严重时可发展为急性呼吸窘迫综合征或多脏器衰竭,甚至引起死亡。目前主流的防治流感药物有生物疫苗、奥司他韦和扎那米韦等神经氨酸酶抑制剂、金刚烷胺类的M2离子通道抑制剂。但现有的抗流感药物容易产生耐药性,而且仅针对单一靶点,开发滞后,完全跟不上流感病毒高抗原漂移的速度,给抗流感药物的开发带来很大挑战[2]。近年来,我国中药及其复方发展迅速,研究表明中药不仅可以通过抑制病毒复制、抵抗病毒导致的细胞病变来治疗流感,还能通过调节机体免疫功能、改善肺循环、镇痛抗炎来治疗流感并发症[3]。因此,运用中药防治流感,开发抗流感药物,有其独特的优势。
丁香为桃金娘科植物丁香EugeniacaryophyllataThunb.的干燥花蕾。具有温中降逆,补肾助阳的功效。主治脾胃虚寒,呃逆呕吐,食少吐泻,心腹冷痛,肾虚阳痿[4]。现代研究表明,丁香主要含有挥发油类、酚酸类、黄酮类、三萜类等成分,具有调节胃肠运动、抗胃溃疡、抗炎、镇痛、抗菌、抗病毒、抗癌等药理作用[5]。有研究证明,丁香具有抗流感病毒活性,但其抗流感病毒作用机制的报道较少,目前只知其能抑制神经氨酸酶而发挥抗流感病毒作用,但是否还存在其他机制仍不清楚[6]。网络药理学是基于生物信息学和系统生物学方法,通过构建“药物-靶点-疾病”网络,分析网络特征协同关系的新学科,近年来被广泛用于预测中药活性成分群和潜在靶点群,以阐述中药作用机制。
本研究拟采用网络药理学对丁香抗流感活性成分的相关靶点及信号通路进行分析,并运用分子对接实验研究丁香活性成分与流感病毒蛋白的结合作用,从分子水平、细胞水平和基因水平探讨丁香抗流感分子机制,为丁香的深入研究及开发利用,为抗流感药物的研发提供参考。
1 资料与方法
1.1 数据库与软件 数据库:中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)(http://tcmspw.com/tcmsp.php)、SwissTarget Prediction数据库(http://www.swisstargetprediction.ch/)、人类基因数据库(GeneCards)(https://www.genecards.org/)、String数据库(https://string-db.org/)、Protein Data Bank数据库(PDB ......
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