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编号:1608975
主成分分析方法在食管癌患者血清代谢物研究中的应用
http://www.100md.com 2010年7月31日 中国医药导报 2010年第23期
模式识别,组学,1仪器与试药,2方法与结果,1NMR实验,2数据预处理,3结果,3讨论
     杨永霞 ,梁敏锋 ,陈阿丽 ,丘翠环 *,张 磊 ,吴怀选

    (1.广东药学院基础学院,广东广州 510006;2.南方医科大学南方医院感染内科,广东广州 510515;3.广东药学院中山校区实验中心,广东中山 528458)

    核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)技术作为一种无侵入、高效的分析手段已经成为代谢组学研究的重要实验方法[1-3],但生物样品(体液、组织)组成复杂,通常高分辨一维1H谱就包含成百上千个的共振峰,即使是经验丰富的波谱学家也很难从复杂的NMR谱中获得全部的有用信息。因此,结合模式识别来分析NMR的实验数据是非常有益的。主成分分析(principal component analysis,PCA)是一种在保持数据信息损失最少的原则下,对高维变量空间进行降维处理的线性映射方法[4]。本文应用高分辨核磁共振1H谱并结合主成分分析方法研究食管癌(esophageal carcinoma,EC)患者血清的代谢组特征,找出与癌变有关的标志性代谢物。

    1 仪器与试药

    于南方医科大学南方医院收集健康人血清10例和食管癌患者血清 20例(2008年 8月~2009年 2月),取 400 μl上层血清加至5 mm NMR测试管中,后加入100 μl 0.2 mol/L磷酸缓冲溶液(pH=7.4)和 50 μl双重水 ......

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