重组人BMP-2诱导C3H10T1/2间质干细胞定向成骨分化早期基因表达谱分析
1材料与方法,2结果,3讨论
左长清 汪宗桂 钟月春 卢旱云 戴忠 吴铁 崔燎1.广东医学院药理学教研室,广东东莞523808;2.广东医学院生物化学教研室,广东东莞523808
重组人BMP-2诱导C3H10T1/2间质干细胞定向成骨分化早期基因表达谱分析
左长清1汪宗桂2钟月春1卢旱云1戴忠1吴铁1崔燎1
1.广东医学院药理学教研室,广东东莞523808;2.广东医学院生物化学教研室,广东东莞523808
目的研究间质干细胞早期定向成骨分化基因表达谱,为研究基因对早期成骨定向分化调控机制提供实验基础。方法分别提取重组人骨形成蛋白2(rhBMP.2)诱导组和对照组C3H10T1/2细胞总RNA,进行扩增标记后,与ArraySTAR小鼠基因芯片杂交,应用生物信息学软件GeneSpring和GATHER对基因芯片数据进行分析。应用STRING在线软件对差异表达基因构建蛋白互作网络并进行网络分析。结果C3H10T1/2早期成骨分化中,主要富集发育、器官形成等分子功能本体以及细胞因子.细胞因子受体作用信号通路。成骨分化1 d和4 d均上调表达基因42个,下调表达基因45个。网络分析研究表明:Egfr、Cxcl12等信号分子参与调控rhBMP.2诱导成骨分化。结论筛选的差异表达基因和信号分子对早期成骨分化调控具有重要作用,为进一步全面解析早期成骨定向分化提供实验基础。
早期成骨分化;基因表达谱;间质干细胞;生物信息学
成骨细胞主要由骨髓间质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)分化而来,在其发育分化的整个过程中,不同的基因严格按照特定的时间顺序开启和关闭,表现为与分化的阶段相一致,支持并且控制着成骨细胞的分化与成熟。因此,骨髓间质干细胞定向成骨分化调控研究在国内外受到高度重视,促进间质干细胞成骨定向分化与成熟,将是治疗骨质疏松症的新的有效方法和手段。但是,目前关于间质干细胞早期成骨定向分化方面的调控机制尚未完全阐明。本实验室采用重组人骨形成蛋白2(rhBMP.2)诱导小鼠间质干细胞C3H10T1/2定向成骨分化细胞模型,采用小鼠全基因组芯片筛选鉴定差异表达基因谱并进行生物信息学分析,探讨rhBMP.2成骨分化调控的差异表达基因集,并进一步通过网络生物学分析,为探讨间质干细胞早期成骨定向分化提供实验依据。
1 材料与方法
1.1 材料
小鼠间质干细胞C3H10T1/2购自中国科学院上海细胞库。rhBMP.2(R&D systems),ArraySTAR mouse lncRNA microarray(8×60 K ......
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