基于网络药理学研究黑豆方主要药物治疗湿疹的作用机制
槲皮素,靶点,1资料与方法,1数据库及软件,2获取药物成分的筛选及靶点,3获取湿疹相关基因及靶点信息,4筛选交集基因,5构建药物-成分-靶点-基因网络,6PPI网络构建与分析,7基因本体(GO)功能和KEGG
曲 尧 范 玉 刘绿野 王钰菁 张 洁 耿立东1.山东中医药大学第一临床医学院,山东济南 250014;2.山东中医药大学附属医院皮肤科,山东济南 250014;3.山东中医药大学中医学院,山东济南 250014
湿疹是由多种内外因素引起的一种具有明显渗出倾向的临床常见的皮肤炎症性疾病,病因目前尚不明确,具有皮疹多型、多对称发生、自觉奇痒、病程缠绵反复的特点,严重影响患者的生活质量。在中医学中湿疹属于湿疮范畴,以清热利湿止痒为主要治法[1]。黑豆方为山东中医药大学附属医院皮肤科临床协定方,在临床治疗中取得了较好效果。本研究选用黑豆方中的6味主要药物:黑豆、马齿苋、地骨皮、黄柏、白鲜皮、白及,基于网络药理学的相关方法,发掘新的疾病相关的潜在治疗靶点,并探索其分子作用机制。
1 资料与方法
1.1 数据库及软件
中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,Version2.3)[2-3],药物靶标数据库(DrugBank,Version5.1.5);GeneCards(Version 4.13),在线人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM);蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络平台STRING(Version 11.0);UniProt蛋白质数据库[4];京都基因和基因组数据库(KEGG,Release 93.0)[5];R软件(Version 3.6.2);Cytoscape(Version 3.7.2)。
1.2 获取药物成分的筛选及靶点
通过TCMSP数据库搜索6味中药的中文名称,对口服生物利用度(OB)和类药性(DL)设定数值(OB≥30%,DL≥0.18)作为筛选条件[6] ......
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