基于网络药理学与分子对接探讨水陆二仙丹治疗糖尿病肾病的潜在分子机制
网络图,槲皮素,靶点,1材料与方法,1药物相关靶点的筛选,2“药物-活性成分-靶点”网络图构建,3疾病相关靶点的筛选,4维恩图及蛋白质-蛋白质相互作用网络构建,5药物-疾病靶点功能与通路富集分
李亚蒙 侯亚威 徐玉坤 李 芮1.山东中医药大学中医学院,山东济南 250000;2.山东中医药大学附属医院老年医学科,山东济南 250000
水陆二仙丹(金樱子-芡实)出自《洪氏经验方》,金樱子生于山上谓之“仙”,味酸甘涩,性平,固精缩尿;芡实生于水中,味甘涩,性亦平,益肾固精;二者用于治疗男子遗精白浊,女子带下及小便频数、遗尿等症状[1]。
糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)的发病机制尚不完全清楚,但与糖代谢紊乱密切相关,作为最严重的微血管并发症之一,DN 已成为终末期肾病主要发病原因,临床上多采用葡萄糖控制、脂质调节、抗氧化和血管紧张素转换酶抑制剂等措施,但效果不理想[2]。因此运用中西医结合的治疗方式被学者普遍认同,在传统祖国医学中,DN 属于“消渴”“水肿”等范畴,中药能够明显延缓DN的进展,减轻患者痛苦。其中水陆二仙丹是治疗DN的常用处方,并取得良好成效[3]。
现为明确水陆二仙丹治疗DN的具体分子机制,运用网络药理学方法,并进行分子对接验证,明确作用靶点及分子机制,为进一步探索DN的发病机制及开发新的治疗药物提供借鉴。
1 材料与方法
1.1 药物相关靶点的筛选
通过中药系统药理学数据库寻找2 味中药化学组成成分,并进行ADME 筛选,按照口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18 两个阈值初步获得药物有效活性成分及其作用的蛋白质靶点,并通过TCMID 及中国知网、万方搜集2015 年1 月至2020 年9 月的文献补充未预测到的靶点,删除未预测到的靶点有效活性成分,将筛选后得到的靶点统一在Uniprot 蛋白质数据库规范化合物作用靶点[4]。
1.2 “药物-活性成分-靶点”网络图构建
将药物活性成分及靶点导入Cytoscape 3.7.2 中,构建“药物-活性成分-靶点”网络图。
1.3 疾病相关靶点的筛选
在GeneCards 数据库中挖掘DN的潜在靶点 ......
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