基于生物信息学分析急性心肌梗死合并慢性阻塞性肺疾病的关键基因和潜在药物
中枢,炎症,数据库,1资料与方法,1微阵列数据收集,2DEG筛选,3DEG的功能富集分析,4PPI网络及中枢基因的鉴定,5预测潜在药物,2结果,1AMI和COPD中DEG分析,2GO和KE
姜晨阳 李 烁 巢潇莺 钟国强广西医科大学第一附属医院心血管内科,广西南宁 530021
急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)是全世界发达国家的主要死亡原因之一[1]。每年有790 000 人被诊断出患有AMI[2]。慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)是一种由慢性炎症引起的不可逆转的肺部疾病,会导致气道和肺实质的损害[3]。全球估计6500 万人患有重度的COPD 并导致死亡[4]。心血管疾病是COPD 患者最常见的并发症[5-6]。AMI 是COPD 患者住院和死亡的主要原因[7]。一项系统评价和meta 分析显示,COPD 患者发生心肌梗死(myocardial infarction,MI)的风险增加[8]。在这项研究中,笔者通过生物信息学方式寻找差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),并进行富集分析然后筛选潜在的治疗药物。因此,识别AMI 和COPD 的中枢基因可能为疾病的诊断治疗提供新的生物信息学依据,获得的分子机制和信号通路可能有助于解释AMI 与COPD 之间的联系。
1 资料与方法
1.1 微阵列数据收集
2012 年1 月至2021 年2 月,从公共的GEO 数据库筛选AMI 和COPD 的微阵列数据集 ......
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