基于网络药理学和分子对接探讨杜仲-淫羊藿-骨碎补组方治疗骨质疏松症的作用机制
成骨细胞,靶点,1材料与方法,1筛选DYG活性成分与作用靶点,2OP靶点查询与筛选,3构建DYG与OP作用靶点网络,4构建蛋白质-蛋白质相互作用(proteinproteininte
吴 鹏 李 莎 时孝晴 廖太阳 陈巨鹏南京中医药大学附属医院骨伤科,江苏南京 210029
骨质疏松症(osteoporosis,OP)是一种骨量低下、骨微结构受到损坏,脆性增加的全身性疾病[1]。目前,西医对OP 的治疗主要以促进骨形成和抑制骨吸收为主,大多药物治疗较为局限,具有一定副作用,而且价格较为昂贵[2]。中医药治疗OP 效果确切、患者依从性较好,在OP 的治疗中占据十分重要的位置[3]。杜仲-淫羊藿-骨碎补(eucommia ulmoides-epimediumrhizoma drynariae,DYG)一直都是中医药治疗OP 的核心药物,也是南京中医药大学附属医院经典名方—补肾活血健骨方的主要组成成分[4-5],但其治疗OP 的主要成分及作用机制尚不明确。
网络药理学能够通过分析“药物-基因-蛋白”的相互作用网络,系统地揭示药物与疾病的相关性[6-7]。本研究基于网络药理学和分子对接,探讨DYG 治疗OP 的潜在机制,为其治疗OP 提供科学依据。
1 材料与方法
1.1 筛选DYG 活性成分与作用靶点
通过检索中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取杜仲、淫羊藿、骨碎补的活性成分,根据成分药物代谢动力学吸收、分布、代谢、排泄参数进行筛选,条件设置如下:药物口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%,药物相似性(drug-likeness,DL)≥0.18,联合Perl 语言与Uniprot 数 据 库(https://www.uniprot.org/uniprot/)筛 选出DYG 的相关靶点[8]。
1.2 OP 靶点查询与筛选
以“Osteoporosis”为关键 词 在GeneCard、OMIM、PharmGkb、Therapeutic Targets 和DrugBank 数据库检索与OP 相关的基因 ......
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