基于网络药理学和分子对接技术研究柴胡桂枝汤治疗抑郁症的作用机制
抗抑郁,1资料与方法,1药物有效成分筛选及靶点预测,2疾病靶点获取,3柴胡桂枝汤与抑郁症交集靶点筛选,4构建活性成分-疾病靶点网络,5构建蛋白质-蛋白质相互作用(proteinproteinint
蓝绍航 罗 俊,2 李娜娜 罗业浩 陈秋霞 陈静芹 李宏一 方 刚,31.广西中医药大学广西壮医应用基础研究重点实验室,广西南宁 530001;2.广西中医药大学现代教育技术与信息中心,广西南宁 530200;3.广西中医药大学附属瑞康医院国医堂,广西南宁 530011
抑郁症是一种常见的精神障碍性疾病[1],世界卫生组织报告指出,2030 年后抑郁症将成为人们最大的健康挑战[2]。抑郁症属于中医“郁证”等范畴,其病位在肝,以肝气郁结为关键病机,治疗上以疏肝理气为原则,遣方用药多以柴胡类方剂疏肝解郁为主[3-4]。柴胡桂枝汤始载于张仲景《伤寒杂病论》,原方主治太阳少阳合病,现代临床可应用于治疗外感、神经系统等多种疾病。现代药理学研究发现[5],柴胡桂枝汤可能是通过增加5-羟色胺的含量而达到抗抑郁的目的。多项研究表明[6-10],临床中运用柴胡桂枝汤治疗抑郁症效果明显。目前临床上运用柴胡桂枝汤治疗抑郁症的研究较多,但仍缺乏对其相关作用机制的全面研究。网络药理学是药物研究的新模式,为中药发展提供了新的研究思想[11]。因此,本研究利用网络药理学结合分子对接技术的思路,深入阐述柴胡桂枝汤多成分、多靶点、多通路协同治疗抑郁症的作用机制,为后续临床实验研究提供相应的理论基础和参考。
1 资料与方法
1.1 药物有效成分筛选及靶点预测
在中药系统药理学数据库和分析平台筛选柴胡桂枝汤(柴胡、桂枝、白芍、黄芩、人参、半夏、生姜、大枣、甘草)的全部化学成分,并以口服生物利用度≥30%、类药性指数≥0.18 为筛选条件,确定药物的活性成分。在“Related Targets”一栏中找出其所对应的作用靶点,将所有药物靶点进行合并整理,剔除重复靶点;利用Perl 语言结合Uniport 数据库对靶点名称进行规范化。
1.2 疾病靶点获取
以抑郁症英文名“Depression”为检索词,限制检索条件为“gene”“homo sapiens”,在GeneCards、在线人类孟德尔遗传、药物基因组学知识库、TTD、DrugBank这5 个数据库中获取抑郁症相关靶点基因,将检索结果合并,删除重复靶点。
1.3 柴胡桂枝汤与抑郁症交集靶点筛选
将上述获得的药物靶点交集与疾病靶点基因交集通过R 语言绘制维恩图 ......
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