基于网络药理学探讨染料木素治疗抑郁症的分子作用机制
输入,1材料与方法,1染料木素作用靶点预测,2抑郁症相关靶点预测,3蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络图的构建,4“成分-靶标-疾病”网络构建与分析,5
胡燕珍 张媛媛 黄 斌 王亚敏 陈 乐▲ 杨 治1.江西省中医药研究院中药研究所,江西南昌 330046;2.江西省儿童医院新生儿外科,江西南昌 330006
抑郁症是最常见的精神疾病之一,以生理、情感和认知障碍为主要特征,伴随的症状包括情绪低落、快感缺失、绝望、精力丧失、有自杀念头等[1]。世界卫生组织预测世界各地已超过3.5 亿人患有这种疾病,涉及各个年龄段[2]。同时,随着每年全球中老年女性的增多,围绝经期抑郁症的发病率呈逐年上升趋势。相关研究表明,在欧美围绝经期妇女中,轻度抑郁症的人占总人数的50%~60%,严重抑郁症占1%~3%[3]。围绝经期抑郁症的发生不仅影响中老年女性的生活质量,同时也给家庭和社会带来了沉重的负担[4]。现代研究认为,围绝经期抑郁症的发生与雌激素的缺乏有关[5]。其中,植物雌激素是一类存在于植物中具有雌激素生物活性的物质,其已作为临床绝经期妇女激素替代疗法的一种新选择。染料木素是植物雌激素的一种,其可选择性地与雌激素受体结合,表现出雌激素与抗雌激素活性。有研究报道,染料木素具有改善绝经后骨质疏松症妇女的生活质量和抑郁症状的能力[6]。但目前有关染料木素治疗围绝经期抑郁症的具体作用机制尚不明确。网络药理学的出现为染料木素治疗抑郁症的作用机制系统研究提供了新的思路和方法。网络药理学是一门以系统生物学理论为基础,采用生物系统网络分析方法,通过选取特定的信号节点对多靶点药物分子进行系统设计的新学科[7]。基于此,本研究采用网络药理学方法,分析和预测染料木素治疗抑郁症的分子作用机制,以期为揭示染料木素治疗抑郁症作用机制的科学内涵提供参考。
1 材料与方法
1.1 染料木素作用靶点预测
通过搜索下列数据库获得染料木素靶向蛋白编码基因的完整列表:中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/index.php)、比较毒理基因组学数据库(http://ctdbase.org/)、TTD(http://bidd.nus.edu.sg/group/cjttd/)。结果仅限于“homo Sapiens”。
1.2 抑郁症相关靶点预测
检索GeneCards(https://www.genecards.org/)和Home-NCBI-Gene(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene)数据库获得潜在抑郁症相关靶点 ......
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