中国脑胶质瘤临床样本库的信息化建设管理实践及问题分析
数据库,1脑胶质瘤临床生物样本库的建立及样本采集标准,2脑胶质瘤临床生物样本库的信息化管理,3脑胶质瘤患者临床和随访资料的信息化管理,4脑胶质瘤临床生物样本库相关科研产出分析,5脑胶质瘤临床生物样本库建立和
陈 虞 王 地 李冠璋, 赵 征 李艺影1.北京市神经外科研究所科研办公室,北京 100070;2.首都医科大学附属北京天坛医院神经外科,北京 100070;3.北京市神经外科研究所分子神经病理室,北京 100070
随着精准医学、转化医学及医疗大数据技术的不断发展,临床生物样本数据库的标准化建设以及规范化管理成为科学研究顺利开展与否的关键因素[1-2]。临床组织样本是十分宝贵的不可再生资源,对探索疾病的发生发展机制、识别药物新靶点及开发新型治疗方法等具有重要意义[3-4]。临床样本的管理不仅需要提高样本量,而且还要注重采集样本的质量、数据管理的规范性及使用的便捷性[5-7]。目前国际上已有数个肿瘤相关大型数据库项目,如美国癌症基因组图谱计划、国际癌症基因组联盟等[8-9]。这些项目产生了海量的多维度组学数据,极大推动了肿瘤病理学、诊断学、预防及治疗等领域的发展,同时做到了数据的高度共享,为世界各地的研究人员提供了进一步深度挖掘和分析研发的契机[10-12]。然而,已有的各种脑胶质瘤临床生物样本库仍存在不足之处,如数据更新缓慢,缺少数据访问、分析和可视化工具等[13]。本文分析了中国脑胶质瘤基因组图谱计划(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)相关临床生物样本库的建立与管理实践,总结高质量、高标准、智能化的临床生物样本库的建设经验。
1 脑胶质瘤临床生物样本库的建立及样本采集标准
2004 年,在王忠诚院士指导下,中国第一个脑胶质瘤综合诊疗中心建成,由北京市神经外科研究所、首都医科大学附属北京天坛医院江涛教授担任中心负责人。江涛教授主要从事转化医学、分子分型、胶质瘤精准治疗等方面的研究,同期,江涛教授作为发起人成立中国脑胶质瘤临床生物样本库[14]。该样本库的临床样本主要来自于首都医科大学附属北京天坛医院、天津医科大学总医院、首都医科大学三博脑科医院、哈尔滨大学第二附属医院、南京医科大学第一附属医院和中国医科大学第一医院等国内多家知名三甲医院。样本采集过程中均获得患者或患者家属的知情同意 ......
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