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编号:508371
基于GEO 数据库甲状腺相关性眼病差异基因免疫浸润机制研究
http://www.100md.com 2022年1月20日 中国医药导报 2021年第35期
肥大细胞,眼眶,1资料与方法,1TAO差异表达基因获取与热图,火山图绘制,2核心的差异基因获取,3差异基因的GO和KEGG富集分析,4获取免疫浸润矩阵,5免疫细胞间的相关性分析和组间差异分析,2结果
     尹谢添 赵诗超 向 楠 陈继东,5 曾明星 周广文

    1.湖北中医药大学第一临床学院,湖北武汉 430061;2.湖北省中医院风湿免疫科,湖北武汉 430061;3.向楠名医工作室,湖北武汉 430061;4.湖北省中医院老年病科,湖北武汉 430061;5.湖北省中医院内分泌科,湖北武汉 430061;6.湖北中医药大学基础医学院,湖北武汉 430061;7.湖北中医药大学针灸骨伤学院,湖北武汉 430061

    甲状腺相关性眼病(thyroid-associated ophthal mopathy,TAO),又称为格雷夫斯眼病(Graves’disease,GD)和甲状腺眼病是一种以眼球后及眼眶周围组织浸润性病变为特征的自身免疫性疾病。TAO 以40~60 岁女性多发,男女患病比例为1∶5[1],总发病率约为0.0422‰[2]。20%~50%的格雷夫斯病患者有眼部受累表现[3],其中5.0%~8.6%的患者会发展成严重阶段[4],如导致甲状腺功能障碍性视神经病变(dysthyroid optic neuropathy,DON)和暴露性角膜溃疡等[5]。TAO 临床症状轻者以眼睛充血、畏光、流泪、异物感、疼痛为主要表现;临床症状重者以眼睑闭合不全、复视、眼球运动障碍、失明为主要表现[6]。其治疗包括基本治疗(戒烟、眼睛局部治疗),维持甲状腺功能稳定治疗,针对突眼治疗(糖皮质激素、免疫抑制剂、硒剂、利妥昔单抗、妥珠单抗、放射治疗、手术治疗)和中草药治疗等[7]。本病对患者生活质量、精神状况常造成重大影响。TAO 发病机制复杂,目前认为其病因病机主要与环境因素、遗传因素和免疫因素有关,尤其是免疫因素常被认为是TAO 发生和进展的核心因素[8]。为了明确其相关免疫机制设计本研究,以期通过数据挖掘的方式得出相关结论,以便未来能够更好地为临床服务。

    1 资料与方法

    1.1 TAO 差异表达基因获取与热图、火山图绘制

    使用GEO 数据库进行检索,搜索“Graves disease”,物种限制为人,对基因芯片数据进行筛选。选定TAO 前眼眶表达基因作为试验组,正常人前眼眶表达基因作为对照组。使用R 软件,设定P <0.05,log FC>0.5,进行差异基因分析,正数代表上调,负数代表下调,获取上调和下调最显著的前20 个基因绘制热图,同时绘制火山图,并将所得的差异基因导入表格中。

    1.2 核心的差异基因获取

    将得到的两组差异基因导入STRING 数据库中,选定物种为人 ......

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