脓毒症心肌功能障碍关键基因的筛选及生物信息学分析
差异基因,外周血,1资料与方法,1基因表达数据集选择,2差异基因筛选,3差异基因生物功能分析,4筛选SIMD关键基因,5绘制蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)
蒋万威 杨国辉贵州医科大学临床医学院,贵州贵阳 550004
脓毒症心肌功能障碍(sepsis-induced myocardial dysfunction,SIMD)是因脓毒症导致的心脏收缩或舒张功能下降,是脓毒症常见的器官功能障碍之一,与患者的生存风险显著相关[1-3]。超过10%的SIMD 患者可进一步发展为脓毒症性心肌病,长期影响患者心功能[4]。至今仍未完全阐明其具体的发病机制,多个潜在病理生理过程可能共同参与其中[5]。现阶段多使用超声多普勒、心肌标志物等辅助措施识别SIMD,但这些指标缺乏特异性,且尚无针对性的治疗措施[6-8]。本研究通过分析高通量基因表达数据库中的多个数据集,对差异表达的基因进行研究,以期发掘SIMD 潜在的研究方向。
1 资料与方法
1.1 基因表达数据集选择
在高通量基因表达数据库中检索脓毒症患者外周血转录组数据集及SIMD 小鼠心肌组织转录组数据集(表1),为匹配脓毒症患者外周血样本选择小鼠盲肠结扎穿孔术(cecal ligation and puncture,CLP)后24 h 的心肌转录组数据为研究对象。

表1 脓毒症患者及脓毒症心肌功能障碍动物模型数据集
1.2 差异基因筛选
人体以脓毒症患者及健康受试者分组 ......
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