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编号:506491
基于铁死亡相关长链非编码RNA对子宫内膜癌的预后分析
http://www.100md.com 2023年9月25日 中国医药导报 2023年第23期
热图,基因,差异,1资料与方法,1铁死亡基因及富集分析,2铁死亡预后lncRNA,3基于预后相关lncRNA构建模型,4应用预后模型进行预后分析,5生存因素的评价,6lncRNA与病理表现间的关系及预测患者
     宋玉莹 崔 琳 孙 蕾 何玉凤 祝慧颖 王 飞 李 焱

    1.河南中医药大学第一临床医学院,河南郑州 450008;2.河南中医药大学第一附属医院中心实验室及心脏中心,河南郑州 450000;3.河南中医药大学第一附属医院体检中心,河南郑州 450000

    2015 年我国新发病子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)病例数6.9 万,发病率为10.28/10 万人[1]。患者阴道不规则出血症状典型,因此多数患者可早期诊断,5 年生存率达95%。当患者出现远处转移或具有高复发风险时,其生存率、治愈率低[2-3]。EC 治疗方法是手术,存在高复发风险时术后给予放疗[4],但会出现严重的不良反应,如急性毒性和长期并发症[5];出现远处转移时术后给予化疗[4],但患者的生理功能和情感状态持久递减[6]。因此,寻找敏感、可靠的标志物对疾病的诊断和治疗至关重要。铁死亡是新型的细胞死亡方式。在肿瘤中调控铁死亡的基因常发生突变,使癌细胞对铁死亡敏感[7]。铁又是癌细胞增殖和发展的必需元素[8]。因此,调节铁死亡水平可能是针对癌症的新型治疗方法。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)虽不编码蛋白,但参与细胞内多种过程的调控,如肿瘤细胞增殖和分化、基因表达的遗传调节、转录调控等的调节[9]。越来越多的研究表明铁死亡相关lncRNA 特征与肿瘤的进展、疗效及预后密切相关[10]。

    1 资料与方法

    1.1 铁死亡基因及富集分析

    ①TCGA 数据库中收集EC 患者的RNA-Seq 数据、临床数据。临床资料包括生存时间、生存状态、年龄、性别、分级等。②FerrDb 数据库中得到铁死亡基因。③通过R 软件将疾病数据与铁死亡基因取交集,得到在癌与癌旁组织中差异表达的铁死亡相关基因,即差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。④以|logFC|≥1、错误发现率<0.05 为条件,利用R 软件的clusterProfiler、enrichplot、ggplot2、stringi、colorspace 安装包对DEGs 进行GO 和KEGG 富集分析 ......

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