基于网络药理学和实验验证研究高良姜素乳膏抗白癜风的作用机制
黑素细胞,1材料与方法,1网络药理学,2动物实验材料,3动物实验方法,4统计学方法,2结果,1GA作用靶点筛选,2白癜风候选靶点,3PPI网络构建,4GO功能富集分析及KEGG通路分析,5GA抗白癜风
祖力皮卡尔·吾斯曼 张数数 闫 明 李治建 霍仕霞1.新疆医科大学药学院,新疆乌鲁木齐 830011;2.新疆维吾尔自治区维吾尔药物研究所,新疆乌鲁木齐 830049;3.新疆维吾尔自治区维吾尔医医院,新疆乌鲁木齐 830049
白癜风是一种常见的黑素细胞缺失导致皮肤出现色素脱失斑的色素障碍性皮肤病,患病率为0.5%~2.0%,其病因尚未确定[1]。目前临床上治疗白癜风的方法有手术、光疗[2]、外用激素[3]、口服免疫抑制剂[4]及抗氧化剂[5]等,虽然有一定的效果,但也有一定的副作用。高良姜素(Galangin,GA)是从高良姜的根部提取的一种天然黄酮(3,5,7-三羟基黄酮),具有抗肿瘤[6]、抗氧化[7]和抗感染[8]活性。本课题组前期研究发现,GA具有促进黑色素合成的作用[9]。本研究运用网络药理学[10-11]及分子对接等分析方法,对GA 乳膏抗白癜风作用机制进行研究,以期为白癜风治疗药物的开发及临床应用提供参考。
1 材料与方法
1.1 网络药理学
1.1.1 作用靶点的筛选 运用Swiss Target Prediction 数据库,获取其吸收、分布、代谢、排泄和毒性水平,并结合中药系统药理学数据库与分析平台的中药动学参数筛选标准对GA 靶点进行筛选。
1.1.2 构建白癜风疾病靶点数据库 利用TTD、OMIM、DrugBank 数据库,以“vitiligo”为关键词,检索与白癜风相关的基因,构建白癜风疾病靶点数据库。
1.1.3 蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络构建 用R 语言进行维恩图映射交集处理药物和疾病靶点,将药物和疾病靶点输入String平台(https://cn.string-db.org/),通过Cytoscape 3.7.1 寻找核心靶点,构建药物-疾病靶点PPI 网络。
1.1.4 基因富集分析 为了阐明GA 治疗白癜风的作用,将得到的核心靶标进行GO 富集分析和KEGG 信号通路富集分析。
1.1.5 分子对接 借助ZINC 数据库(http://zinc.docking.org/)下载GA 的3D 结构,作为对接配体。采用Auto Tools 对核心靶点晶体结构蛋白进行预处理,作为分子对接的受体。以配体和受体使用Autodock Vina 1.2进行对接,最后取优势构象进行分析,对接结果中Vina 分值≤-4.5,说明关键靶点与化合物的结合能力较好[12] ......
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