抵抗素基因单核苷酸多态性与2型糖尿病的相关性研究(1)
[摘要] 目的 探讨抵抗素基因rs34861192单核苷酸多态性与2型糖尿病的关系。 方法 分别测定2型糖尿病组(T2DM组)100例及正常对照组(CON组)150例空腹血糖(FBG)、空腹胰岛素(FIN)、甘油三酯(TG)、总胆固醇(CHOL)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-CH)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-CH)和抵抗素,并计算胰岛素抵抗指数(IRI);同时采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对T2DM组和CON组进行抵抗素rs34861192位点基因型的检测,根据结果进行综合分析。 结果 T2DM 患者FBG、FIN、IRI、TG、抵抗素的检测数值[分别为(9.96±5.86) mmol/mL,(12.23±9.21) μg/mL,6.25±4.13,(2.02±1.85) mmol/mL,(7.24±3.65) ng/mL]高于健康人群的检测数值[分别为(4.94±0.50) mmol/mL,(5.63±2.66) μg/mL,1.24±0.62,(1.33±0.74) mmol/mL,(1.44±0.93) ng/mL],差异有统计学意义(t值 分别为8.535,4.586,4.936,3.516,15.524,P均<0.05);T2DM组和CON组抵抗素rs34861192位点的基因型分布分别为AA6%、AG40%、GG54%和 AA 0.7%、AG20%、GG79.3%;抵抗素基因rs34861192位点的基因型分布和等位基因频率在T2DM组和CON组间有统计学意义(χ2值分别为20.231、19.103,P均<0.05)。 结论 抵抗素可能是T2DM的危险因子,抵抗素基因rs34861192位点多态性与2型糖尿病相关,同时可能对脂代谢有一定影响。
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[关键词] 抵抗素;基因多态性;2型糖尿病
[中图分类号] R541 [文献标识码] B [文章编号] 1673-9701(2012)21-0048-04
人的抵抗素基因存在多种单核苷酸多态性(SNP)现象,而SNP与2型糖尿病间的相关性,目前并无统一定论,可能与研究样本的数量、病例及位点的选取有关,更可能与不同种族间的糖尿病易感性及个体差异有关。我们研究抵抗素水平和抵抗素基因rs34861192位点多态性与T2DM的关系,分析此抵抗素基因是否为2型糖尿病的易感基因,为2型糖尿病的早期预测、诊断、治疗及预后提供分子生物学依据。
1材料与方法
1.1材料
仪器与试剂 ① 实验仪器:质谱检测仪(MassARRAY Analyzer Compact),点样仪(MassARRAY Nanodispenser),384 孔双头 PCR 仪(GeneAmp PCR System 9700 Dual 384-Well Sample Block Module),6mg 384纯化板(SEQUENOM 公司),STAR全自动样本工作站和FAME全自动酶标分析仪,罗氏cobase 411 全自动电化学发光免疫分析仪。 ② 主要试剂:通用基因组DNA提取试剂盒(广州市达晖生物技术有限公司),iPLEX PCR反应试剂盒(SEQUENOM 公司),384-well SpectroCHIP 生物芯片(SEQUENOM 公司),HOTSTART Taq酶(SEQUENOM 公司),虾碱性磷酸酶(SAP酶,SEQUENOM 公司),阳离子交换树脂(SEQUENOM 公司),阳性质控YH(深圳华大基因研究院培育的“炎黄一号”细胞株DNA),抵抗素(RapidBio Lab Calabasaa),胰岛素(Abbott Japan CO,LTD),葡萄糖、总胆固醇、甘油三酯(中生北控生物科技股份有限公司),高密度脂蛋白胆固醇(日本第一化学药品株式会社),低密度脂蛋白胆固醇(DiaSys Diagnostie Systems GmbH,德赛)。
, 百拇医药
1.2 对象
(1)正常对照组(CON组):健康体检的150例个体,无T2DM(均检测空腹及餐后2 h血糖),无冠心病(无主述史并且心电图无异常),体重指数(body mass index,BMI)<25 kg/m2。(2)T2DM组:新诊断的T2DM患者100例(符合1999年WHO糖尿病诊断标准和亚太地区成人超重和(或)肥胖标准):①糖尿病症状+任意时间血浆葡萄糖水平>11.1 mmol/L(200 mg/dl);②空腹血浆葡萄糖(FPG)水平>7.0 mmol/L(126 mg/dl);③OGTT试验中,餐后2 h血糖水平>11.1 mmol/L(200 mg/dl)。未用过胰岛素,噻唑烷二酮类及其他口服降糖药物,并排除继发性2型糖尿病的可能。
1.3 方法
①样本采集 所有受检者均隔夜空腹8 h以上,清晨抽静脉血8 mL,其中一支EDTA-K2抗凝血2 mL,充分摇匀,彻底抗凝,作抵抗素单核苷酸多态性之用。两支干燥管各注入3 mL血液,干燥管3 000 rpm/min离心15 min;一支分离血清,-20°C保存,用于抵抗素、胰岛素检测;另一支检测基础生化项目,包括空腹葡萄糖(FPG)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-CH)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-CH)。②基因分型 按通用基因组DNA提取试剂盒说明书提取基因组DNA。由广东省深圳市华大基因公司采用美国 SEQUENOM 公司的MassARRAY 时间飞行质谱技术(MALDI-TOF MS)完成对抵抗素SNP的基因分型。通过 PCR 扩增,SAP 酶处理,延伸引物单碱基延伸,树脂除盐纯化,芯片点样,质谱检测等实验步骤,最终使用 Typer 4.0 软件分析实验数据,获得基因分型结果。③抵抗素的检测 采用双抗体夹心ELISA法。实验仪器为STAR全自动样本工作站和FAME全自动酶标分析仪。④空腹胰岛素(fasting insulin,FIN)的检测 采用化学发光技术即化学发光微粒免疫分析。实验仪器为罗氏cobase 411 全自动电化学发光免疫分析仪。计算胰岛素抵抗指数(HOMA-IR),IRI=空腹血糖×空腹胰岛素/22.5。⑤其他生化指标的检测 空腹葡萄糖采用葡萄糖氧化酶法测定,总胆固醇、甘油三酯、高密度脂蛋白胆固醇采用终点法测定,低密度脂蛋白胆固醇采用选择性抑制直接法测定。, http://www.100md.com(杨冰 刘忠民)
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[关键词] 抵抗素;基因多态性;2型糖尿病
[中图分类号] R541 [文献标识码] B [文章编号] 1673-9701(2012)21-0048-04
人的抵抗素基因存在多种单核苷酸多态性(SNP)现象,而SNP与2型糖尿病间的相关性,目前并无统一定论,可能与研究样本的数量、病例及位点的选取有关,更可能与不同种族间的糖尿病易感性及个体差异有关。我们研究抵抗素水平和抵抗素基因rs34861192位点多态性与T2DM的关系,分析此抵抗素基因是否为2型糖尿病的易感基因,为2型糖尿病的早期预测、诊断、治疗及预后提供分子生物学依据。
1材料与方法
1.1材料
仪器与试剂 ① 实验仪器:质谱检测仪(MassARRAY Analyzer Compact),点样仪(MassARRAY Nanodispenser),384 孔双头 PCR 仪(GeneAmp PCR System 9700 Dual 384-Well Sample Block Module),6mg 384纯化板(SEQUENOM 公司),STAR全自动样本工作站和FAME全自动酶标分析仪,罗氏cobase 411 全自动电化学发光免疫分析仪。 ② 主要试剂:通用基因组DNA提取试剂盒(广州市达晖生物技术有限公司),iPLEX PCR反应试剂盒(SEQUENOM 公司),384-well SpectroCHIP 生物芯片(SEQUENOM 公司),HOTSTART Taq酶(SEQUENOM 公司),虾碱性磷酸酶(SAP酶,SEQUENOM 公司),阳离子交换树脂(SEQUENOM 公司),阳性质控YH(深圳华大基因研究院培育的“炎黄一号”细胞株DNA),抵抗素(RapidBio Lab Calabasaa),胰岛素(Abbott Japan CO,LTD),葡萄糖、总胆固醇、甘油三酯(中生北控生物科技股份有限公司),高密度脂蛋白胆固醇(日本第一化学药品株式会社),低密度脂蛋白胆固醇(DiaSys Diagnostie Systems GmbH,德赛)。
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1.2 对象
(1)正常对照组(CON组):健康体检的150例个体,无T2DM(均检测空腹及餐后2 h血糖),无冠心病(无主述史并且心电图无异常),体重指数(body mass index,BMI)<25 kg/m2。(2)T2DM组:新诊断的T2DM患者100例(符合1999年WHO糖尿病诊断标准和亚太地区成人超重和(或)肥胖标准):①糖尿病症状+任意时间血浆葡萄糖水平>11.1 mmol/L(200 mg/dl);②空腹血浆葡萄糖(FPG)水平>7.0 mmol/L(126 mg/dl);③OGTT试验中,餐后2 h血糖水平>11.1 mmol/L(200 mg/dl)。未用过胰岛素,噻唑烷二酮类及其他口服降糖药物,并排除继发性2型糖尿病的可能。
1.3 方法
①样本采集 所有受检者均隔夜空腹8 h以上,清晨抽静脉血8 mL,其中一支EDTA-K2抗凝血2 mL,充分摇匀,彻底抗凝,作抵抗素单核苷酸多态性之用。两支干燥管各注入3 mL血液,干燥管3 000 rpm/min离心15 min;一支分离血清,-20°C保存,用于抵抗素、胰岛素检测;另一支检测基础生化项目,包括空腹葡萄糖(FPG)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-CH)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-CH)。②基因分型 按通用基因组DNA提取试剂盒说明书提取基因组DNA。由广东省深圳市华大基因公司采用美国 SEQUENOM 公司的MassARRAY 时间飞行质谱技术(MALDI-TOF MS)完成对抵抗素SNP的基因分型。通过 PCR 扩增,SAP 酶处理,延伸引物单碱基延伸,树脂除盐纯化,芯片点样,质谱检测等实验步骤,最终使用 Typer 4.0 软件分析实验数据,获得基因分型结果。③抵抗素的检测 采用双抗体夹心ELISA法。实验仪器为STAR全自动样本工作站和FAME全自动酶标分析仪。④空腹胰岛素(fasting insulin,FIN)的检测 采用化学发光技术即化学发光微粒免疫分析。实验仪器为罗氏cobase 411 全自动电化学发光免疫分析仪。计算胰岛素抵抗指数(HOMA-IR),IRI=空腹血糖×空腹胰岛素/22.5。⑤其他生化指标的检测 空腹葡萄糖采用葡萄糖氧化酶法测定,总胆固醇、甘油三酯、高密度脂蛋白胆固醇采用终点法测定,低密度脂蛋白胆固醇采用选择性抑制直接法测定。, http://www.100md.com(杨冰 刘忠民)