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编号:670938
四种提取诺如病毒和副溶血性弧菌总RNA方法的比较
http://www.100md.com 2016年12月22日 中国现代医生 2016年第29期
柱式,磁珠,1材料与方法,2结果,3讨论
     白颉 郭慈浩 罗智强 陈栋

    1.浙江省舟山出入境检验检疫局,浙江舟山316000;2.浙江省温州市疾病预防控制中心,浙江温州325000

    四种提取诺如病毒和副溶血性弧菌总RNA方法的比较

    白颉1郭慈浩1罗智强1陈栋2

    1.浙江省舟山出入境检验检疫局,浙江舟山316000;2.浙江省温州市疾病预防控制中心,浙江温州325000

    目的比较四种联合提取诺如病毒和副溶血性弧菌总RNA的方法。方法使用Trizol法、磁珠法、QiagenTMRNA Mini Kit和柱式RNA抽提试剂盒分别提取诺如病毒和副溶血性弧菌的总RNA,经核酸测定仪检测RNA的质量,并用RT-PCR法对四种提取方法进行比较。结果QiagenTMRNA Mini Kit的提取效率最佳,对PCR的反应影响最小。磁珠法其次,但是磁珠法提取出的总RNA纯度也较高。Trizol法和柱式法总RNA抽提试剂盒所获得的总RNA比上述两者低,且存在不同程度的污染。经随机区组方差分析显示,四种提取方法之间存在显著性差异,F浓度=11.313;F(A260/A280)=15.093;F(A260/A230)=11.155,P均<0.05。结论四种试剂的实际提取效率存在差异,应根据不同的样本情况选择合适的试剂。

    诺如病毒;副溶血性弧菌;总RNA;逆转录PCR;提取

    RNA是微生物中重要的遗传分子,获取高品质的RNA是样本前处理的基本要求,是后续进行分子生物学实验提供优质模板的前提。虽然国内已经建立了相对成熟的RNA提取方法,但是缺乏联合提取病毒和细菌两种不同病原微生物RNA的相关报道。目前国内市场上常见的RNA提取试剂有Qiagen的RNA MiniKit,PROGEMA的SV TotalRNA Isolation System,上海生工的柱式Trizol总RNA抽提试剂盒以及上海之江的磁珠柱RNA抽提试剂盒。除此之外,张倩等[1]用改良SDS/酚法提取总RNA,提取得到的产物完整性强、质量好、产率高,适合进一步的分子生物学实验研究。但是不同的提取原理以及不同的品牌对RNA的提取浓度和纯度有着巨大的差异。而提取高质量的RNA用以研究病原微生物的毒力基因表达、致病性和环境适应性变得尤为重要。本研究尝试以诺如病毒和副溶血性弧菌的总RNA提取为例,使用Trizol法、磁珠法核酸提取试剂盒、QiagenTMRNA Mini Kit和柱式总RNA抽提试剂盒四种方法提取总RNA,经核酸测定仪检测RNA的质量,并用RT-PCR法对四种提取方法进行比较,寻找出更适合用于两种病原体总RNA的提取 ......

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