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编号:13062623
炎症性肠病的基因共表达网络构建与分析(3)
http://www.100md.com 2017年3月25日 《中国现代医生》 2017年第9期
     利用WGCNA分析得到的每个模块的表达值,对12个共表达模块在炎症性肠病行了分析,发现有4个模块在克罗恩病和溃疡性结肠炎中存在差异(P<0.05),分别是7、10、13和14模块,分别和胺基糖代谢、O-Glycan合成、血管生成、B细胞受体信号通路相关,与CD相比,在UC分别是下调、下调、上调、上调(表4)。

    2.5 共表达模块可以用于治疗药物的发现

    为了进一步验证这些共表达模块的重要性,使用药物处理细胞系的基因芯片数据进行分析,得到每个模块在不同药物处理中的表达值,根据表达值大小可以进行排序,筛选潜在的治疗药物。

    3 讨论

    WGCNA已经被多个研究证明是有效的基因共表达网络构建方法,大量文献无法一一列举[8]。其应用于人脑转录组分析,发现对应于不同脑区域的共表达模块[9]。肿瘤中,WGCNA分析鉴定到了所有肿瘤细胞株保守的基因表达模块,并具有临床意义[10]。本文也采用该方法,对IBD二代测序转录组数据分析 ......
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