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编号:670185
基于生物信息学分析LPAR5在甲状腺乳头状癌中的表达及其意义
http://www.100md.com 2021年7月7日 中国现代医生 2021年第9期
     李娜 连续 兰宏伟 许红昕

    [摘要] 目的 通過生物信息学的方法分析溶血磷脂酸受体5(LPAR5)在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及临床意义,为PTC分子生物研究和生物标志物筛选提供理论依据。 方法 2020年5月开始从GEO数据库中筛选数据,最终筛选出编号为GSE3678的基因芯片,并对样本进行规范化处理,筛选出差异表达基因LPAR5。利用TCGA数据库验证LPAR5在甲状腺癌组织和正常甲状腺组织差异表达情况,同时在ulcan数据库分析LPAR5表达与PTC患者临床特征之间的关系。通过GEPIA2分析LPAR5基因与甲状腺癌生存率之间的关系。 结果 共筛选出甲状腺癌差异基因755个,其中表达上调差异基因314个,表达下调差异基因441个,基于TCGA基因表达数据分析得出LPAR5在甲状腺癌中表达高于正常甲状腺组织,LPAR5表达量与甲状腺癌患者的临床分期和N分期密切相关(P0.05),GEPIA2分析显示甲状腺癌患者LPAR5高表达组总生存率高于低表达组(P0.05)。 结论 本研究通过生物信息学分析得到了甲状腺癌中的部分差异基因,并通过TCGA数据库分析进一步验证了LPAR5在甲状腺癌中的高表达,且与肿瘤临床分期和N分期密切相关,进一步证明了LPAR5可能参与PTC的发生发展,并影响PTC淋巴结转移。

    [关键词] 甲状腺乳头状癌;LPAR5;生物信息学;GEO;TCGA;GEPIA2

    [中图分类号] R736.1? ? ? ? ? [文献标识码] A? ? ? ? ? [文章编号] 1673-9701(2021)09-0001-04

    The expression and significance of LPAR5 in papillary thyroid carcinoma based on bioinformatics

    LI Na1? ?LIAN Xu1? ?LAN Hongwei2? ?XU Hongxin1

    1.Department of Endocrinology, Hongqi Hospital Affiliated to Mudanjiang Medical College, Mudanjiang? ?157000, China; 2.Department of Oncology, Hongqi Hospital Affiliated to Mudanjiang Medical College, Mudanjiang? ?157000, China;

    [Abstract] Objective To analyze the expression and clinical significance of lysophosphatidic acid receptor 5 (LPAR5) in papillary thyroid carcinoma(PTC) by means of bioinformatics ......

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