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编号:2295623
单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析IgA肾病关键基因的调控作用
http://www.100md.com 2024年12月12日 中国现代医生 2024年第35期
    

    [摘要]"目的"探讨IgA肾病(IgA"nephropathy,IgAN)中重点细胞类型的基因表达及关键基因ADI1、BNIP3L、SERPINE2对IgAN发生、发展的调控作用。方法"采用基因表达综合数据库(gene"expression"omnibus,GEO)和eQTLGen联盟数据库,通过孟德尔随机化(mendelian"randomization,MR)和单细胞RNA测序(single-cell"gene"expression,scRNA-seq),探讨IgAN的关键细胞类型及ADI1、BNIP3L、SERPINE2与IgAN间的因果关系。使用Seurat软件包读取表达谱并筛选低表达基因,通过差异基因表达分析筛选TOP100高表达基因,采用敏感性分析和异质性检验选择显著的基因结果。最后,通过重要基因的调控网络分析和微小核糖核酸(microRNA,miRNA)网络构建对MR结果进行验证。结果"ADI1(OR=0.946,95%CI:0.900~0.994,P=0.029)、BNIP3L(OR=0.820,95%CI:0.707~0.950,P=0.008)、SERPINE2(OR=0.958,95%CI:0.919~0.999,P=0.045)可能与IgAN风险降低相关。KLF6(OR=1.318,95%CI:1.036~1.678,P=0.025)与IgAN的风险升高相关。结论"揭示包括近端肾小管细胞在内的18种关键细胞类型的基因特征,确定ADI1、BNIP3L、SERPINE2与IgAN发生、发展的调控作用密切相关。

    [关键词]"单细胞RNA测序;孟德尔随机化;IgA肾病;关键基因;慢性肾病

    [中图分类号]"R692.5"""""""[文献标识码]"A""""[DOI]"10.3969/j.issn.1673-9701.2024.35.002

    Single-cell"RNA"sequencing"and"Mendelian"randomization"to"analyze"regulatory"role"of"key"genes"in"IgA"nephropathy

    QIU"Minhua1 ......

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