一种从石蜡包埋结直肠癌组织中获取基因组DNA的简便、快速、重复性好的方法
二甲苯,琼脂糖,水浴,1材料与方法,2结果,3讨论
李德钢 李裕波 陈泛野 黄小明 黄世佳 江家鹏 吴卫 黄深 庞黎明(广西中医药大学第一附属医院外二科 广西南宁 530023)
从基因水平阐明肿瘤发病机制已是目前一种常规研究手段,但短期内获取大量人体新鲜组织标本较困难,且部分研究涉及回顾性分析,这就需要借助于病理科长期保存的福尔马林固定石蜡包埋组织(FFPET)标本,然而从石蜡包埋组织标本中提取DNA难度较新鲜组织大,虽然目前已有较多这方面的研究[1~3],但寻求一种简便、快速、批量、重复性好的方法一直是广大科研工作者的追求。从石蜡包埋组织中提取DNA的方法,一般主要包括脱蜡、消化和纯化3个步骤,笔者在实验过程中,将传统二甲苯脱蜡与DNA提取试剂盒相结合,摸索出一种从石蜡包埋结直肠癌组织中批量提取DNA的简便、快速、重复性好的方法,现报告如下。
1 材料与方法
1.1 材料 随机选取广西中医大学第一附属医院2009年3月至2013年10月手术切除的福尔马林固定110例石蜡包埋结直肠癌组织标本。无菌操作常规切片,标本经石蜡切片机切成厚度10μm的6片组织装入1.5mL EP管中,每个标本用刀片的不同部位切片,每张刀片用完后均用二甲苯、无水乙醇处理后再次切片。
1.2 主要试剂 二甲苯分析纯、无水乙醇分析纯(成都市科龙化工试剂厂),20mg/mL蛋白酶K溶液(TaKaRa,目录号D9033),北京天根公司血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒(TIANamp Genomic DNA Kit)(目录号:DP304-03),RIRP裂解液(碧云天公司,P0031E-1),2×Taq PCR Master Mix(北京天根公司,目录号KT201-02),DNA MarkerⅠ(北京天根公司,目录号:MD101-01),琼脂糖(西班牙进口) ......
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