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编号:443884
湘产百合核心种质库的SRAP体系的建立
http://www.100md.com 2014年5月23日 湖南中医药大学学报 2014年第12期
条带,1材料与方法,2结果与分析,3讨论
     高 昱,易刚强,刘平安,邹君华,蔡嘉洛,张亚利,童巧珍*(.湖南中医药大学,湖南 长沙 4008;.平江县南江学区石浆中学,湖南 岳阳 40400)

    ·中药化学·

    湘产百合核心种质库的SRAP体系的建立

    高 昱1,易刚强1,刘平安1,邹君华2,蔡嘉洛1,张亚利1,童巧珍1*

    (1.湖南中医药大学,湖南 长沙 410208;2.平江县南江学区石浆中学,湖南 岳阳 410400)

    目的 确立适用于湘产百合核心种质库的相关序列扩增多态性(SRAP)反应体系。方法 根据构建核心种质库的需求,对实验步骤、评分规则进行针对性改良,通过Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶、模板5因素4水平的正交试验与单因素试验构建SRAP体系,并筛选出适用引物。结果 最佳反应体系 (20 μL):Mg2+浓度2.5 mmol/L,dNTPs浓度0.20 μmol/L,引物浓度0.20 μmol/L,Taq酶1.0 U,模板DNA 50 ng能获得明亮清晰的扩增条带;并由144对引物组合中筛选出32对产物稳定、多态性丰富的引物组合。结论 该体系具有较高的稳定性,并可提高引物使用率,满足百合核心种质构建对大信息量的需求,适用于湘产百合核心种质库的研究。

    百合;核心种质;相关序列扩增多态性;体系优化

    百合来源于单子叶植物亚纲百合科(Liliaccae)百合属(Lilium)植物:卷丹(Liliwn lancifolium Thunb)、百合(L.brownii var.viridulum Baker)、细叶百合(L.pumilum DC)的干燥肉质鳞叶,含有酚酸甘油酯、苷类、生物碱、多糖等活性成分[1],其现代药理学研究表明百合具有抗疲劳、抗肿瘤、降血糖、免疫调节、镇静及抗应激损伤等多种作用[2-4],集药用、食用和观赏为一体。湖南为我国百合主要产区之一,更是拥有龙牙百合、龙山百合资源地理标志权的特色优势[5]。

    核心种质库能以最少的重复代表一个种及野生近缘种的最大范围的遗传多样性,能够提高种质资源的利用率;但构建过程需要丰富的样品子集信息,且需要对子集信息进行及时更新,对信息获得和处理有着较高的要求[6-7]。相关序列扩增多态性分子标记(SRAP)结合了AFLP及RAPD各自的优点,具有高效性、引物通用、不需预先知道DNA序列信息,共显性率高,可快速获得大量信息[8],符合核心种质构建的需求。现今,湖南百合种质资源遭到破坏和不合理开发的现况,为保护百合种质和指导合理开发研究,因此有必要建立用于构建湘产百合核心种质库的SRAP体系 ......

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